生物化學(xué)簡明教程第四版課后習(xí)題及答案.doc
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1、1 緒論1生物化學(xué)研究的對象和內(nèi)容是什么?解答:生物化學(xué)主要研究:(1)生物機(jī)體的化學(xué)組成、生物分子的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)及功能;(2)生物分子分解與合成及反應(yīng)過程中的能量變化;(3)生物遺傳信息的儲存、傳遞和表達(dá);(4)生物體新陳代謝的調(diào)節(jié)與控制。2你已經(jīng)學(xué)過的課程中哪些內(nèi)容與生物化學(xué)有關(guān)。提示:生物化學(xué)是生命科學(xué)的基礎(chǔ)學(xué)科,注意從不同的角度,去理解并運(yùn)用生物化學(xué)的知識。3說明生物分子的元素組成和分子組成有哪些相似的規(guī)侓。解答:生物大分子在元素組成上有相似的規(guī)侓性。碳、氫、氧、氮、磷、硫等6種是蛋白質(zhì)、核酸、糖和脂的主要組成元素。碳原子具有特殊的成鍵性質(zhì),即碳原子最外層的4個電子可使碳與自身形成共價單
2、鍵、共價雙鍵和共價三鍵,碳還可與氮、氧和氫原子形成共價鍵。碳與被鍵合原子形成4個共價鍵的性質(zhì),使得碳骨架可形成線性、分支以及環(huán)狀的多種多性的化合物。特殊的成鍵性質(zhì)適應(yīng)了生物大分子多樣性的需要。氮、氧、硫、磷元素構(gòu)成了生物分子碳骨架上的氨基(NH2)、羥基(OH)、羰基()、羧基(COOH)、巰基(SH)、磷酸基(PO4 )等功能基團(tuán)。這些功能基團(tuán)因氮、硫和磷有著可變的氧化數(shù)及氮和氧有著較強(qiáng)的電負(fù)性而與生命物質(zhì)的許多關(guān)鍵作用密切相關(guān)。生物大分子在結(jié)構(gòu)上也有著共同的規(guī)律性。生物大分子均由相同類型的構(gòu)件通過一定的共價鍵聚合成鏈狀,其主鏈骨架呈現(xiàn)周期性重復(fù)。構(gòu)成蛋白質(zhì)的構(gòu)件是20種基本氨基酸。氨基酸之
3、間通過肽鍵相連。肽鏈具有方向性(N 端C端),蛋白質(zhì)主鏈骨架呈“肽單位”重復(fù);核酸的構(gòu)件是核苷酸,核苷酸通過3, 5-磷酸二酯鍵相連,核酸鏈也具有方向性(5、3 ),核酸的主鏈骨架呈“磷酸-核糖(或脫氧核糖)”重復(fù);構(gòu)成脂質(zhì)的構(gòu)件是甘油、脂肪酸和膽堿,其非極性烴長鏈也是一種重復(fù)結(jié)構(gòu);構(gòu)成多糖的構(gòu)件是單糖,單糖間通過糖苷鍵相連,淀粉、纖維素、糖原的糖鏈骨架均呈葡萄糖基的重復(fù)。2 蛋白質(zhì)化學(xué)1用于測定蛋白質(zhì)多肽鏈N端、C端的常用方法有哪些?基本原理是什么?解答:(1) N-末端測定法:常采用二硝基氟苯法、Edman降解法、丹磺酰氯法。二硝基氟苯(DNFB或FDNB)法:多肽或蛋白質(zhì)的游離末端氨基與
4、二硝基氟苯(DNFB)反應(yīng)(Sanger反應(yīng)),生成DNP多肽或DNP蛋白質(zhì)。由于DNFB與氨基形成的鍵對酸水解遠(yuǎn)比肽鍵穩(wěn)定,因此DNP多肽經(jīng)酸水解后,只有N末端氨基酸為黃色DNP氨基酸衍生物,其余的都是游離氨基酸。 丹磺酰氯(DNS)法:多肽或蛋白質(zhì)的游離末端氨基與與丹磺酰氯(DNSCl)反應(yīng)生成DNS多肽或DNS蛋白質(zhì)。由于DNS與氨基形成的鍵對酸水解遠(yuǎn)比肽鍵穩(wěn)定,因此DNS多肽經(jīng)酸水解后,只有N末端氨基酸為強(qiáng)烈的熒光物質(zhì)DNS氨基酸,其余的都是游離氨基酸。 苯異硫氰酸脂(PITC或Edman降解)法:多肽或蛋白質(zhì)的游離末端氨基與異硫氰酸苯酯(PITC)反應(yīng)(Edman反應(yīng)),生成苯氨基硫
5、甲酰多肽或蛋白質(zhì)。在酸性有機(jī)溶劑中加熱時,N末端的PTC氨基酸發(fā)生環(huán)化,生成苯乙內(nèi)酰硫脲的衍生物并從肽鏈上掉下來,除去N末端氨基酸后剩下的肽鏈仍然是完整的。 氨肽酶法:氨肽酶是一類肽鏈外切酶或叫外肽酶,能從多肽鏈的N端逐個地向里切。根據(jù)不同的反應(yīng)時間測出酶水解釋放的氨基酸種類和數(shù)量,按反應(yīng)時間和殘基釋放量作動力學(xué)曲線,就能知道該蛋白質(zhì)的N端殘基序列。(2)C末端測定法:常采用肼解法、還原法、羧肽酶法。肼解法:蛋白質(zhì)或多肽與無水肼加熱發(fā)生肼解,反應(yīng)中除C端氨基酸以游離形式存在外,其他氨基酸都轉(zhuǎn)變?yōu)橄鄳?yīng)的氨基酸酰肼化物。 還原法:肽鏈C端氨基酸可用硼氫化鋰還原成相應(yīng)的氨基醇。肽鏈完全水解后,代表原
6、來C末端氨基酸的氨基醇,可用層析法加以鑒別。 羧肽酶法:是一類肽鏈外切酶,專一的從肽鏈的C末端開始逐個降解,釋放出游離的氨基酸。被釋放的氨基酸數(shù)目與種類隨反應(yīng)時間的而變化。根據(jù)釋放的氨基酸量(摩爾數(shù))與反應(yīng)時間的關(guān)系,便可以知道該肽鏈的C末端氨基酸序列。2測得一種血紅蛋白含鐵0.426%,計算其最低相對分子質(zhì)量。一種純酶按質(zhì)量計算含亮氨酸1.65%和異亮氨酸2.48%,問其最低相對分子質(zhì)量是多少?解答:(1)血紅蛋白:(2)酶:因?yàn)榱涟彼岷彤惲涟彼岬南鄬Ψ肿淤|(zhì)量相等,所以亮氨酸和異亮氨酸的殘基數(shù)之比為:1.65%:2.48%=2:3,因此,該酶分子中至少含有2個亮氨酸,3個異亮氨酸。3指出下面
7、pH條件下,各蛋白質(zhì)在電場中向哪個方向移動,即正極,負(fù)極,還是保持原點(diǎn)?(1)胃蛋白酶(pI 1.0),在pH 5.0;(2)血清清蛋白(pI 4.9),在pH 6.0;(3)-脂蛋白(pI 5.8),在pH 5.0和pH 9.0;解答:(1)胃蛋白酶pI 1.0環(huán)境pH 5.0,帶負(fù)電荷,向正極移動;(2)血清清蛋白pI 4.9環(huán)境pH 6.0,帶負(fù)電荷,向正極移動;(3)-脂蛋白pI 5.8環(huán)境pH 5.0,帶正電荷,向負(fù)極移動;-脂蛋白pI 5.8環(huán)境pH 9.0,帶負(fù)電荷,向正極移動。4何謂蛋白質(zhì)的變性與沉淀?二者在本質(zhì)上有何區(qū)別?解答:蛋白質(zhì)變性的概念:天然蛋白質(zhì)受物理或化學(xué)因素的影
8、響后,使其失去原有的生物活性,并伴隨著物理化學(xué)性質(zhì)的改變,這種作用稱為蛋白質(zhì)的變性。變性的本質(zhì):分子中各種次級鍵斷裂,使其空間構(gòu)象從緊密有序的狀態(tài)變成松散無序的狀態(tài),一級結(jié)構(gòu)不破壞。蛋白質(zhì)變性后的表現(xiàn):生物學(xué)活性消失;理化性質(zhì)改變:溶解度下降,黏度增加,紫外吸收增加,側(cè)鏈反應(yīng)增強(qiáng),對酶的作用敏感,易被水解。蛋白質(zhì)由于帶有電荷和水膜,因此在水溶液中形成穩(wěn)定的膠體。如果在蛋白質(zhì)溶液中加入適當(dāng)?shù)脑噭?,破壞了蛋白質(zhì)的水膜或中和了蛋白質(zhì)的電荷,則蛋白質(zhì)膠體溶液就不穩(wěn)定而出現(xiàn)沉淀現(xiàn)象。沉淀機(jī)理:破壞蛋白質(zhì)的水化膜,中和表面的凈電荷。蛋白質(zhì)的沉淀可以分為兩類:(1)可逆的沉淀:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)未發(fā)生顯著的變化,
9、除去引起沉淀的因素,蛋白質(zhì)仍能溶于原來的溶劑中,并保持天然性質(zhì)。如鹽析或低溫下的乙醇(或丙酮)短時間作用蛋白質(zhì)。(2)不可逆沉淀:蛋白質(zhì)分子內(nèi)部結(jié)構(gòu)發(fā)生重大改變,蛋白質(zhì)變性而沉淀,不再能溶于原溶劑。如加熱引起蛋白質(zhì)沉淀,與重金屬或某些酸類的反應(yīng)都屬于此類。蛋白質(zhì)變性后,有時由于維持溶液穩(wěn)定的條件仍然存在,并不析出。因此變性蛋白質(zhì)并不一定都表現(xiàn)為沉淀,而沉淀的蛋白質(zhì)也未必都已經(jīng)變性。5下列試劑和酶常用于蛋白質(zhì)化學(xué)的研究中:CNBr,異硫氰酸苯酯,丹磺酰氯,脲,6mol/L HCl -巰基乙醇,水合茚三酮,過甲酸,胰蛋白酶,胰凝乳蛋白酶,其中哪一個最適合完成以下各項任務(wù)?(1)測定小肽的氨基酸序列
10、。(2)鑒定肽的氨基末端殘基。(3)不含二硫鍵的蛋白質(zhì)的可逆變性。若有二硫鍵存在時還需加什么試劑?(4)在芳香族氨基酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。(5)在甲硫氨酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。(6)在賴氨酸和精氨酸殘基側(cè)水解肽鍵。解答:(1)異硫氰酸苯酯;(2)丹黃酰氯;(3)脲;-巰基乙醇還原二硫鍵;(4)胰凝乳蛋白酶;(5)CNBr;(6)胰蛋白酶。 6由下列信息求八肽的序列。(1)酸水解得 Ala,Arg,Leu,Met,Phe,Thr,2Val。(2)Sanger試劑處理得DNP-Ala。(3)胰蛋白酶處理得Ala,Arg,Thr 和 Leu,Met,Phe,2Val。當(dāng)以Sanger試劑處理時分別得到
11、DNP-Ala和DNP-Val。(4)溴化氰處理得 Ala,Arg,高絲氨酸內(nèi)酯,Thr,2Val,和 Leu,Phe,當(dāng)用Sanger試劑處理時,分別得DNP-Ala和DNP-Leu。解答:由(2)推出N末端為Ala;由(3)推出Val位于N端第四,Arg為第三,而Thr為第二;溴化氰裂解,得出N端第六位是Met,由于第七位是Leu,所以Phe為第八;由(4),第五為Val。所以八肽為:Ala-Thr-Arg-Val-Val-Met-Leu-Phe。7一個螺旋片段含有180個氨基酸殘基,該片段中有多少圈螺旋?計算該-螺旋片段的軸長。解答:180/3.6=50圈,500.54=27nm,該片段
12、中含有50圈螺旋,其軸長為27nm。8當(dāng)一種四肽與FDNB反應(yīng)后,用5.7mol/LHCl水解得到DNP-Val及其他3種氨基酸;當(dāng)這四肽用胰蛋白酶水解時發(fā)現(xiàn)兩種碎片段;其中一片用LiBH4(下標(biāo))還原后再進(jìn)行酸水解,水解液內(nèi)有氨基乙醇和一種在濃硫酸條件下能與乙醛酸反應(yīng)產(chǎn)生紫(紅)色產(chǎn)物的氨基酸。試問這四肽的一級結(jié)構(gòu)是由哪幾種氨基酸組成的?解答:(1)四肽與FDNB反應(yīng)后,用5.7mol/LHCl水解得到DNP-Val,證明N端為Val。(2)LiBH4還原后再水解,水解液中有氨基乙醇,證明肽的C端為Gly。(3)水解液中有在濃H2SO4條件下能與乙醛酸反應(yīng)產(chǎn)生紫紅色產(chǎn)物的氨基酸,說明此氨基酸
13、為Trp。說明C端為GlyTrp(4)根據(jù)胰蛋白酶的專一性,得知N端片段為ValArg(Lys),以(1)、(2)、(3)結(jié)果可知道四肽的順序:NValArg(Lys)TrpGlyC。9概述測定蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的基本步驟。解答:(1)測定蛋白質(zhì)中氨基酸組成。(2)蛋白質(zhì)的N端和C端的測定。(3)應(yīng)用兩種或兩種以上不同的水解方法將所要測定的蛋白質(zhì)肽鏈斷裂,各自得到一系列大小不同的肽段。(4)分離提純所產(chǎn)生的肽,并測定出它們的序列。(5)從有重疊結(jié)構(gòu)的各個肽的序列中推斷出蛋白質(zhì)中全部氨基酸排列順序。如果蛋白質(zhì)含有一條以上的肽鏈,則需先拆開成單個肽鏈再按上述原則確定其一級結(jié)構(gòu)。如是含二硫鍵的蛋白質(zhì),也
14、必須在測定其氨基酸排列順序前,拆開二硫鍵,使肽鏈分開,并確定二硫鍵的位置。拆開二硫鍵可用過甲酸氧化,使胱氨酸部分氧化成兩個半胱氨磺酸。3 核酸1 電泳分離四種核苷酸時,通常將緩沖液調(diào)到什么pH?此時它們是向哪極移動?移動的快慢順序如何? 將四種核苷酸吸附于陰離子交換柱上時,應(yīng)將溶液調(diào)到什么pH? 如果用逐漸降低pH的洗脫液對陰離子交換樹脂上的四種核苷酸進(jìn)行洗脫分離,其洗脫順序如何?為什么? 解答: 電泳分離4種核苷酸時應(yīng)取pH3.5 的緩沖液,在該pH時,這4種單核苷酸之間所帶負(fù)電荷差異較大,它們都向正極移動,但移動的速度不同,依次為:UMPGMPAMPCMP; 應(yīng)取pH8.0,這樣可使核苷酸
15、帶較多負(fù)電荷,利于吸附于陰離子交換樹脂柱。雖然pH 11.4時核苷酸帶有更多的負(fù)電荷,但pH過高對分離不利。 當(dāng)不考慮樹脂的非極性吸附時,根據(jù)核苷酸負(fù)電荷的多少來決定洗脫速度,則洗脫順序?yàn)镃MPAMP GMP UMP,但實(shí)際上核苷酸和聚苯乙烯陰離子交換樹脂之間存在著非極性吸附,嘌呤堿基的非極性吸附是嘧啶堿基的3倍。靜電吸附與非極性吸附共同作用的結(jié)果使洗脫順序?yàn)椋篊MP AMP UMP GMP。2為什么DNA不易被堿水解,而RNA容易被堿水解?解答:因?yàn)镽NA的核糖上有2-OH基,在堿作用下形成2,3-環(huán)磷酸酯,繼續(xù)水解產(chǎn)生2-核苷酸和3-核苷酸。DNA的脫氧核糖上無2-OH基,不能形成堿水解的
16、中間產(chǎn)物,故對堿有一定抗性。3一個雙螺旋DNA分子中有一條鏈的成分A = 0.30,G = 0.24, 請推測這一條鏈上的T和C的情況。 互補(bǔ)鏈的A,G,T和C的情況。解答: T + C = 10.300.24 = 0.46; T = 0.30,C = 0.24,A + G = 0.46。4對雙鏈DNA而言, 若一條鏈中(A + G)/(T + C)= 0.7,則互補(bǔ)鏈中和整個DNA分子中(A+G)/(T+C)分別等于多少? 若一條鏈中(A + T)/(G + C)= 0.7,則互補(bǔ)鏈中和整個DNA分子中(A + T)/(G + C)分別等于多少 ? 解答: 設(shè)DNA的兩條鏈分別為和則: A=
17、 T,T= A,G= C,C= G,因?yàn)椋?A+ G)/(T+ C)= (T+ C)/(A+ G)= 0.7, 所以互補(bǔ)鏈中(A+ G)/(T+ C)= 1/0.7 =1.43;在整個DNA分子中,因?yàn)锳 = T, G = C,所以,A + G = T + C,(A + G)/(T + C)= 1; 假設(shè)同(1),則A+ T= T+ A,G+ C= C+ G,所以,(A+ T)/(G+ C)=(A+ T)/(G+ C)= 0.7 ;在整個DNA分子中,(A+ T+ A+ T)/(G+C+ G+C)= 2(A+ T)/2(G+C)= 0.75T7噬菌體DNA(雙鏈B-DNA)的相對分子質(zhì)量為2.
18、5107,計算DNA鏈的長度(設(shè)核苷酸對的平均相對分子質(zhì)量為640)。 解答:0.34 (2.5107/640)= 1.3 104nm = 13m。6如果人體有1014個細(xì)胞,每個體細(xì)胞的DNA含量為6.4 109個堿基對。試計算人體DNA的總長度是多少?是太陽地球之間距離(2.2 109 km)的多少倍?已知雙鏈DNA每1000個核苷酸重1 10-18g,求人體DNA的總質(zhì)量。 解答:每個體細(xì)胞的DNA的總長度為:6.4 109 0.34nm = 2.176 109 nm = 2.176m,人體內(nèi)所有體細(xì)胞的DNA的總長度為:2.176m1014 = 2.1761011km,這個長度與太陽地
19、球之間距離(2.2109 km)相比為:2.176 1011/2.2 109 = 99倍,每個核苷酸重1 10-18g/1000 = 10-21g,所以,總DNA 6.4 1023 10-21 = 6.4 102 = 640g。7有一個X噬菌體突變體的DNA長度是15m,而正常X噬菌體DNA的長度為17m,計算突變體DNA中丟失掉多少堿基對?解答:(1715) 103/0.34 = 5.88 103bp8概述超螺旋DNA的生物學(xué)意義。解答: 超螺旋DNA比松弛型DNA更緊密,使DNA分子的體積更小,得以包裝在細(xì)胞內(nèi); 超螺旋會影響雙螺旋分子的解旋能力,從而影響到DNA與其他分子之間的相互作用;
20、 超螺旋有利于DNA的轉(zhuǎn)錄、復(fù)制及表達(dá)調(diào)控。9為什么自然界的超螺旋DNA多為負(fù)超螺旋?解答:環(huán)狀DNA自身雙螺旋的過度旋轉(zhuǎn)或旋轉(zhuǎn)不足都會導(dǎo)致超螺旋,這是因?yàn)槌菪龑⑹狗肿幽軌蜥尫庞捎谧陨硇D(zhuǎn)帶來的應(yīng)力。雙螺旋過度旋轉(zhuǎn)導(dǎo)致正超螺旋,而旋轉(zhuǎn)不足將導(dǎo)致負(fù)超螺旋。雖然兩種超螺旋都能釋放應(yīng)力,但是負(fù)超螺旋時,如果發(fā)生DNA解鏈(即氫鏈斷開,部分雙螺旋分開)就能進(jìn)一步釋放應(yīng)力,而DNA轉(zhuǎn)錄和復(fù)制需要解鏈。因此自然界環(huán)狀DNA采取負(fù)超螺旋,這可以通過拓?fù)洚悩?gòu)酶的操作實(shí)現(xiàn)。10真核生物基因組和原核生物基因組各有哪些特點(diǎn)?解答: 不同點(diǎn): 真核生物DNA含量高,堿基對總數(shù)可達(dá)10 11,且與組蛋白穩(wěn)定結(jié)合形成染
21、色體,具有多個復(fù)制起點(diǎn)。原核生物DNA含量低,不含組蛋白,稱為類核體,只有一個復(fù)制起點(diǎn)。 真核生物有多個呈線形的染色體;原核生物只有一條環(huán)形染色體。 真核生物DNA中含有大量重復(fù)序列,原核生物細(xì)胞中無重復(fù)序列。 真核生物中為蛋白質(zhì)編碼的大多數(shù)基因都含有內(nèi)含子(有斷裂基因);原核生物中不含內(nèi)含子。 真核生物的RNA是細(xì)胞核內(nèi)合成的,它必須運(yùn)輸穿過核膜到細(xì)胞質(zhì)才能翻譯,這樣嚴(yán)格的空間間隔在原核生物內(nèi)是不存在的。 原核生物功能上密切相關(guān)的基因相互靠近,形成一個轉(zhuǎn)錄單位,稱操縱子,真核生物不存在操縱子。 病毒基因組中普遍存在重疊基因,但近年發(fā)現(xiàn)這種情況在真核生物也不少見。相同點(diǎn):都是由相同種類的核苷酸
22、構(gòu)成的的雙螺旋結(jié)構(gòu),均是遺傳信息的載體,均含有多個基因。11如何看待RNA功能的多樣性?它的核心作用是什么? 解答:RNA的功能主要有: 控制蛋白質(zhì)合成; 作用于RNA轉(zhuǎn)錄后加工與修飾; 參與細(xì)胞功能的調(diào)節(jié); 生物催化與其他細(xì)胞持家功能;遺傳信息的加工;可能是生物進(jìn)化時比蛋白質(zhì)和DNA更早出現(xiàn)的生物大分子。其核心作用是既可以作為信息分子又可以作為功能分子發(fā)揮作用。12什么是DNA變性?DNA變性后理化性質(zhì)有何變化?解答:DNA雙鏈轉(zhuǎn)化成單鏈的過程稱變性。引起DNA變性的因素很多,如高溫、超聲波、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、有機(jī)溶劑和某些化學(xué)試劑(如尿素,酰胺)等都能引起變性。DNA變性后的理化性質(zhì)變化主要有:
23、 天然DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)解鏈變成單鏈的無規(guī)則線團(tuán),生物學(xué)活性喪失; 天然的線型DNA分子直徑與長度之比可達(dá)110,其水溶液具有很大的黏度。變性后,發(fā)生了螺旋-線團(tuán)轉(zhuǎn)變,黏度顯著降低; 在氯化銫溶液中進(jìn)行密度梯度離心,變性后的DNA浮力密度大大增加,故沉降系數(shù)S增加; DNA變性后,堿基的有序堆積被破壞,堿基被暴露出來,因此,紫外吸收值明顯增加,產(chǎn)生所謂增色效應(yīng)。 DNA分子具旋光性,旋光方向?yàn)橛倚?。由于DNA分子的高度不對稱性,因此旋光性很強(qiáng),其a = 150。當(dāng)DNA分子變性時,比旋光值就大大下降。13哪些因素影響Tm值的大???解答:影響Tm的因素主要有: G-C對含量。G-C對含3個氫
24、鍵,A-T對含2個氫鍵,故G-C對相對含量愈高,Tm亦越高(圖3-29)。在0.15mol/L NaCl,0.015mol/L檸檬酸鈉溶液(1SSC)中,經(jīng)驗(yàn)公式為:(G+C)% =(Tm - 69.3) 2.44。 溶液的離子強(qiáng)度。離子強(qiáng)度較低的介質(zhì)中,Tm較低。在純水中,DNA在室溫下即可變性。分子生物學(xué)研究工作中需核酸變性時,常采用離子強(qiáng)度較低的溶液。 溶液的pH。高pH下,堿基廣泛去質(zhì)子而喪失形成氫鍵的有力,pH大于11.3時,DNA完全變性。pH低于5.0時,DNA易脫嘌呤,對單鏈DNA進(jìn)行電泳時,常在凝膠中加入NaOH以維持變性關(guān)態(tài)。 變性劑。甲酰胺、尿素、甲醛等可破壞氫鍵,妨礙堿
25、堆積,使Tm下降。對單鏈DNA進(jìn)行電泳時,常使用上述變性劑。14哪些因素影響DNA復(fù)性的速度?解答:影響復(fù)性速度的因素主要有: 復(fù)性的溫度,復(fù)性時單鏈隨機(jī)碰撞,不能形成堿基配對或只形成局部堿基配對時,在較高的溫度下兩鏈重又分離,經(jīng)過多次試探性碰撞才能形成正確的互補(bǔ)區(qū)。所以,核酸復(fù)性時溫度不宜過低,Tm-25是較合適的復(fù)性溫度。 單鏈片段的濃度,單鏈片段濃度越高,隨機(jī)碰撞的頻率越高,復(fù)性速度越快。 單鏈片段的長度,單鏈片段越大,擴(kuò)散速度越慢,鏈間錯配的概率也越高。因面復(fù)性速度也越慢,即DNA的核苷酸對數(shù)越多,復(fù)性的速度越慢,若以 C0為單鏈的初始濃度,t為復(fù)性的時間,復(fù)性達(dá)一半時的C0t值稱C0
26、t1/2,該數(shù)值越小,復(fù)性的速度越快。 單鏈片段的復(fù)雜度,在片段大小相似的情況下,片段內(nèi)重復(fù)序列的重復(fù)次數(shù)越多,或者說復(fù)雜度越小,越容易形成互補(bǔ)區(qū),復(fù)性的速度就越快。真核生物DNA的重復(fù)序列就是復(fù)生動力學(xué)的研究發(fā)現(xiàn)的,DNA的復(fù)雜度越小,復(fù)性速度越快。15概述分子雜交的概念和應(yīng)用領(lǐng)域。解答:在退火條件下,不同來源的DNA互補(bǔ)區(qū)形成雙鏈,或DNA單鏈和RNA單鏈的互補(bǔ)區(qū)形成DNA-RNA雜合雙鏈的過程稱分子雜交。通常對天然或人工合成的DNA或RNA片段進(jìn)行放射性同位素或熒光標(biāo)記,做成探針,經(jīng)雜交后,檢測放射性同位素或熒光物質(zhì)的位置,尋找與探針有互補(bǔ)關(guān)系的DNA或RNA。直接用探針與菌落或組織細(xì)胞
27、中的核酸雜交,因未改變核酸所在的位置,稱原位雜交技術(shù)。將核酸直接點(diǎn)在膜上,再與探針雜交稱點(diǎn)雜交,使用狹縫點(diǎn)樣器時,稱狹縫印跡雜交。該技術(shù)主要用于分析基因拷貝數(shù)和轉(zhuǎn)錄水平的變化,亦可用于檢測病原微生物和生物制品中的核酸污染狀況。雜交技術(shù)較廣泛的應(yīng)用是將樣品DNA切割成大小不等的片段,經(jīng)凝膠電泳分離后,用雜交技術(shù)尋找與探針互補(bǔ)的DNA片段。由于凝膠機(jī)械強(qiáng)度差,不適合于雜交過程中較高溫度和較長時間的處理,Southern 提出一種方法,將電泳分離的DNA片段從凝膠轉(zhuǎn)移到適當(dāng)?shù)哪ぃㄈ缦跛崂w維素膜或尼龍膜)上,在進(jìn)行雜交操作,稱Southern印跡法,或Southern雜交技術(shù)。隨后,Alwine等提出
28、將電泳分離后的變性RNA吸印到適當(dāng)?shù)哪ど显龠M(jìn)行分子雜交的技術(shù),被戲稱為 Northern印跡法,或Northern雜交。分子雜交廣泛用于測定基因拷貝數(shù)、基因定位、確定生物的遺傳進(jìn)化關(guān)系等。Southern雜交和Northern雜交還可用于研究基因變異,基因重排,DNA多態(tài)性分析和疾病診斷。雜交技術(shù)和PCR技術(shù)的結(jié)合,使檢出含量極少的DNA成為可能。促進(jìn)了雜交技術(shù)在分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用。DNA芯片技術(shù)也是以核酸的分子雜交為基礎(chǔ)的。16概述核酸序列測定的方法和應(yīng)用領(lǐng)域。解答:DNA的序列測定目前多采用Sanger提出的鏈終止法,和Gilbert提出的化學(xué)法。其中鏈終止法經(jīng)不斷改進(jìn),使用日
29、益廣泛。鏈終止法測序的技術(shù)基礎(chǔ)主要有: 用凝膠電泳分離DNA單鏈片段時,小片段移動,大片段移動慢,用適當(dāng)?shù)姆椒煞蛛x分子大小僅差一個核苷酸的DNA片段。 用合適的聚合酶可以在試管內(nèi)合成單鏈DNA模板的互補(bǔ)鏈。反應(yīng)體系中除單鏈模板外,還應(yīng)包括合適的引物,4種脫氧核苷三磷酸和若干種適量的無機(jī)離子。如果在4個試管中分別進(jìn)行合成反應(yīng),每個試管的反應(yīng)體系能在一種核苷酸處隨機(jī)中斷鏈的合成,就可以得到4套分子大小不等的片段,如新合成的片段序列為-CCATCGTTGA-,在A處隨機(jī)中斷鏈的合成,可得到-CCA和-CCATCGTA兩種片段,在G處中斷合成可得到-CCATCG和-CCATCGTTG兩種片段。在C和
30、T處中斷又可以得到相應(yīng)的2套片段。用同位素或熒光物質(zhì)標(biāo)記這4套新合成的鏈,在凝膠中置于4個泳道中電泳,檢測這4套片段的位置,即可直接讀出核苷酸的序列。 在特定堿基處中斷新鏈合成最有效的辦法,是在上述4個試管中按一定比例分別加入一種相應(yīng)的2,3-雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP),由于ddNTP的3位無-OH,不可能形成磷酸二酯鍵,故合成自然中斷。如上述在A處中斷的試管內(nèi),既有dATP,又有少量的ddATP,新合成的-CCA鏈中的A如果是ddAMP,則鏈的合成中斷,如果是dAMP,則鏈仍可延伸。因此,鏈中有幾個A,就能得到幾種大小不等的以A為末端的片段。如果用放射性同位素標(biāo)記新合成的鏈,則4個試管中
31、新合成的鏈在凝膠的4個泳道電泳后,經(jīng)放射自顯影可檢測帶子的位置,由帶子的位置可以直接讀出核苷酸的序列。采用T7測序酶時,一次可讀出400多個核苷酸的序列。近年采用4種射波長不同的熒光物質(zhì)分別標(biāo)記4種不同的雙脫氧核苷酸,終止反應(yīng)后4管反應(yīng)物可在同一泳道電泳,用激光掃描收集電泳信號,經(jīng)計算機(jī)處理 可將序列直接打印出來。采用毛細(xì)管電泳法測序時,這種技術(shù)一次可測定700個左右核苷酸的序列,一臺儀器可以有幾十根毛細(xì)管同時進(jìn)行測序,且電泳時間大大縮短,自動測序技術(shù)的進(jìn)步加快了核酸測序的步伐,現(xiàn)已完成了包括人類在內(nèi)的幾十個物種的基因組測序。RNA序列測定最早采用的是類似蛋白質(zhì)序列測定的片段重疊法,Holle
32、y用此法測定酵母丙氨酸t(yī)RNA序列耗時達(dá)數(shù)年之久。隨后發(fā)展了與DNA測序類似的直讀法,但仍不如DNA測序容易,因此,常將RNA反轉(zhuǎn)錄成互補(bǔ)DNA(cDNA),測定cDNA序列后推斷RNA的序列,目前16S rRNA 1 542 b的全序列測定,23S rRNA 2 904 b的全序列測定,噬菌體MS2 RNA 3 569 b的全序列測定均已完成。4 糖類的結(jié)構(gòu)與功能1書寫-D-吡喃葡萄糖,L- (-)葡萄糖,-D- (+)吡喃葡萄糖的結(jié)構(gòu)式,并說明D、 L;+、-;、各符號代表的意義。解答:書寫單糖的結(jié)構(gòu)常用D、L;d 或(+)、l或(-);、表示。D-、L-是人為規(guī)定的單糖的構(gòu)型。是以D-、
33、L-甘油醛為參照物,以距醛基最遠(yuǎn)的不對稱碳原子為準(zhǔn), 羥基在左面的為L構(gòu)型, 羥基在右的為D構(gòu)型。單糖由于具有不對稱碳原子,可使平面偏振光的偏振面發(fā)生一定角度的旋轉(zhuǎn),這種性質(zhì)稱為旋光性。其旋轉(zhuǎn)角度稱為旋光度,偏振面向左旋轉(zhuǎn)稱為左旋,向右則稱為右旋。d 或(+)表示單糖的右旋光性,l或(-)表示單糖的左旋光性。2寫出下列糖的結(jié)構(gòu)式:-D-葡萄糖-1-磷酸,2-脫氧-D-呋喃核糖,-D-呋喃果糖,D-甘油醛-3-磷酸,蔗糖,葡萄糖醛酸。解答:略。3已知某雙糖能使本尼地(Benedict)試劑中的Cu2+氧化成Cu2O的磚紅色沉淀,用-葡糖糖苷酶可將其水解為兩分子-D-吡喃葡糖糖,將此雙糖甲基化后再
34、水解將得到2,3,4,6-四氧甲基-D-吡喃葡糖糖和1,2,3,6-四氧甲基-D-吡喃葡糖糖,試寫出此雙糖的名稱和結(jié)構(gòu)式。解答:蔗糖雙糖能使本尼地(Benedict)試劑中的Cu2+氧化成Cu2O的磚紅色沉淀,說明該雙糖具還原性,含有半縮醛羥基。用葡糖苷酶可將其水解為兩分子-D-吡喃葡糖, 說明該雙糖是由-糖苷鍵構(gòu)成的。將此雙糖甲基化后再水解將得到2,3,4,6-四氧甲基-D-吡喃葡糖糖和1,2,3,6-四氧甲基-D-吡喃葡糖, 糖基上只有自由羥基才能被甲基化,說明-葡糖(14)葡糖構(gòu)成的為纖維二糖。4根據(jù)下列單糖和單糖衍生物的結(jié)構(gòu): (A) (B) (C) (D) (1)寫出其構(gòu)型(D或L)
35、和名稱;(2)指出它們能否還原本尼地試劑;(3) 指出哪些能發(fā)生成苷反應(yīng)。解答:(1) 構(gòu)型是以D-,L-甘油醛為參照物,以距醛基最遠(yuǎn)的不對稱碳原子為準(zhǔn), 羥基在左面的為L構(gòu)型, 羥基在右的為D構(gòu)型。A、B、C為D構(gòu)型,D為L構(gòu)型。(2) B、C、D均有醛基具還原性,可還原本尼地試劑。A為酮糖,無還原性。(3) 單糖的半縮醛上羥基與非糖物質(zhì)(醇、酚等)的羥基形成的縮醛結(jié)構(gòu)稱為糖苷, B,C,D均能發(fā)生成苷反應(yīng)。5透明質(zhì)酸是細(xì)胞基質(zhì)的主要成分,是一種黏性的多糖,分子量可達(dá)100000,由兩單糖衍生物的重復(fù)單位構(gòu)成,請指出該重復(fù)單位中兩組分的結(jié)構(gòu)名稱和糖苷鍵的結(jié)構(gòu)類型。解答:透明質(zhì)酸的兩個重復(fù)單位
36、是由D葡萄糖醛酸和N-乙酰氨基葡萄糖通過-1,3糖苷鍵連接而成。6纖維素和淀粉都是由14糖苷鍵連接的D葡萄糖聚合物,相對分子質(zhì)量也相當(dāng),但它們在物理性質(zhì)上有很大的不同,請問是什么結(jié)構(gòu)特點(diǎn)造成它們在物理性質(zhì)上的如此差別? 解釋它們各自性質(zhì)的生物學(xué)優(yōu)點(diǎn)。解答:淀粉是葡萄糖聚合物,既有1,4 糖苷鍵,也有1,6糖苷鍵,為多分支結(jié)構(gòu)。直鏈淀粉分子的空間構(gòu)象是卷曲成螺旋形的,每一回轉(zhuǎn)為6個葡萄糖基,淀粉在水溶液中混懸時就形成這種螺旋圈。支鏈淀粉分子中除有-(1,4)糖苷鍵的糖鏈外,還有-(1,6)糖苷鍵連接的分支處,每一分支平均約含2030個葡萄糖基,各分支也都是卷曲成螺旋。螺旋構(gòu)象是碘顯色反應(yīng)的必要條
37、件。碘分子進(jìn)入淀粉螺旋圈內(nèi),糖游離羥基成為電子供體,碘分子成為電子受體,形成淀粉碘絡(luò)合物,呈現(xiàn)顏色。其顏色與糖鏈的長度有關(guān)。當(dāng)鏈長小于6個葡萄糖基時,不能形成一個螺旋圈,因而不能呈色。當(dāng)平均長度為20個葡萄糖基時呈紅色,紅糊精、無色糊精也因而得名。大于60個葡萄糖基的直鏈淀粉呈藍(lán)色。支鏈淀粉相對分子質(zhì)量雖大,但分支單位的長度只有 2030個葡萄糖基,故與碘反應(yīng)呈紫紅色。纖維素雖然也是由D-吡喃葡萄糖基構(gòu)成,但它是以-(1,4)糖苷鍵連接的一種沒有分支的線性分子,它不卷曲成螺旋。纖維素分子的鏈與鏈間,能以眾多氫鍵像麻繩樣擰在一起,構(gòu)成堅硬的不溶于水的纖維狀高分子(也稱纖維素微晶束),構(gòu)成植物的細(xì)
38、胞壁。人和哺乳動物體內(nèi)沒有纖維素酶(cellulase),因此不能將纖維素水解成葡萄糖。雖然纖維素不能作為人類的營養(yǎng)物,但人類食品中必須含纖維素。因?yàn)樗梢源龠M(jìn)胃腸蠕動、促進(jìn)消化和排便。7說明下列糖所含單糖的種類、糖苷鍵的類型及有無還原性? (1)纖維二糖 (2)麥芽糖(3)龍膽二糖 (4)海藻糖(5)蔗糖 (6)乳糖解答:(1)纖維二糖含葡萄糖,1,4 糖苷鍵,有還原性。(2)麥芽糖含葡萄糖,1,4 糖苷鍵,有還原性。(3)龍 膽二糖含葡萄糖,1,6 糖苷鍵,有還原性。(4)海藻糖含葡萄糖,1,1 糖苷鍵, 無還原性。(5)蔗糖含葡萄糖和果糖,1,2糖苷鍵,無還原性。(6)乳糖含葡萄糖和半乳
39、糖,1,4糖苷鍵,有還原性。8人的紅細(xì)胞質(zhì)膜上結(jié)合著一個寡糖鏈,對細(xì)胞的識別起重要作用。被稱為抗原決定基團(tuán)。根據(jù)不同的抗原組合,人的血型主要分為A型、B型、AB型和O型4類。不同血型的血液互相混合將發(fā)生凝血,危及生命。X已知4種血型的差異僅在X位組成成分的不同。請指出不同血型(A型、B型、AB型、O型)X位的糖基名稱。解答:A型X位是N-乙酰氨基-D-半乳糖;B型X位是-D-半乳糖;AB型X位蒹有A型和B型的糖;O型X位是空的。9請寫出下列結(jié)構(gòu)式:(1) L巖藻糖 (2)D半乳糖(3) N乙酰氨基D葡萄糖 (4) N乙酰氨基D半乳糖胺解答:略。10隨著分子生物學(xué)的飛速發(fā)展,生命的奧秘正在逐漸被
40、揭示。大量的研究已表明,各種錯綜復(fù)雜的生命現(xiàn)象的產(chǎn)生和疾病的形成過程均與糖蛋白的糖鏈有關(guān)。請閱讀相關(guān)資料,列舉你感興趣的糖的生物學(xué)功能。解答:略。5 脂類化合物和生物膜1簡述脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)和生物學(xué)作用。解答:(1)脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):脂質(zhì)是生物體內(nèi)一大類不溶于水而易溶于非極性有機(jī)溶劑的有機(jī)化合物,大多數(shù)脂質(zhì)的化學(xué)本質(zhì)是脂肪酸和醇形成的酯及其衍生物。脂肪酸多為4碳以上的長鏈一元羧酸,醇成分包括甘油、鞘氨醇、高級一元醇和固醇。脂質(zhì)的元素組成主要為碳、氫、氧,此外還有氮、磷、硫等。(2)脂質(zhì)的生物學(xué)作用:脂質(zhì)具有許多重要的生物功能。脂肪是生物體貯存能量的主要形式,脂肪酸是生物體的重要代謝燃料,生物體表面
41、的脂質(zhì)有防止機(jī)械損傷和防止熱量散發(fā)的作用。磷脂、糖脂、固醇等是構(gòu)成生物膜的重要物質(zhì),它們作為細(xì)胞表面的組成成分與細(xì)胞的識別、物種的特異性以及組織免疫性等有密切的關(guān)系。有些脂質(zhì)(如萜類化合物和固醇等)還具有重要生物活性,具有維生素、激素等生物功能。脂質(zhì)在生物體中還常以共價鍵或通過次級鍵與其他生物分子結(jié)合形成各種復(fù)合物,如糖脂、脂蛋白等重要的生物大分子物質(zhì)。2概述脂肪酸的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)。解答:(1)脂肪酸的結(jié)構(gòu):脂肪酸分子為一條長的烴鏈(“尾”)和一個末端羧基(“頭”)組成的羧酸。烴鏈以線性為主,分枝或環(huán)狀的為數(shù)甚少。根據(jù)烴鏈?zhǔn)欠耧柡?,可將脂肪酸分為飽和脂肪酸和不飽和脂肪酸?2)脂肪酸的性質(zhì):脂肪酸
42、的物理性質(zhì)取決于脂肪酸烴鏈的長度和不飽和程度。烴鏈越長,非極性越強(qiáng),溶解度也就越低。脂肪酸的熔點(diǎn)也受脂肪酸烴鏈的長度和不飽和程度的影響。脂肪酸中的雙鍵極易被強(qiáng)氧化劑,如H2O2、超氧陰離子自由基()、羥自由基(OH)等所氧化,因此含不飽和脂肪酸豐富的生物膜容易發(fā)生脂質(zhì)過氧化作用,從而繼發(fā)引起膜蛋白氧化,嚴(yán)重影響膜的結(jié)構(gòu)和功能。脂肪酸鹽屬于極性脂質(zhì),具有親水基(電離的羧基)和疏水基(長的烴鏈),是典型的兩親性化合物,屬于離子型去污劑。必需脂肪酸中的亞油酸和亞麻酸可直接從植物食物中獲得,花生四烯酸則可由亞油酸在體內(nèi)轉(zhuǎn)變而來。它們是前列腺素、血栓噁烷和白三烯等生物活性物質(zhì)的前體。3概述磷脂、糖脂和固
43、醇類的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和生物學(xué)作用解答:. 磷脂包括甘油磷脂和鞘磷脂兩類,它們主要參與細(xì)胞膜系統(tǒng)的組成,少量存在于其他部位。(1)甘油磷脂的結(jié)構(gòu):甘油磷脂是由sn-甘油-3-磷酸衍生而來,分子中甘油的兩個醇羥基與脂肪酸成酯,第三個醇羥基與磷酸成酯或磷酸再與其他含羥基的物質(zhì)(如膽堿、乙醇胺、絲氨酸等醇類衍生物)結(jié)合成酯。(2)甘油磷脂的理化性質(zhì):物理性質(zhì):甘油磷脂脂雙分子層結(jié)構(gòu)在水中處于熱力學(xué)的穩(wěn)定狀態(tài),構(gòu)成生物膜的結(jié)構(gòu)基本特征之一化學(xué)性質(zhì):a. 水解作用:在弱堿溶液中,甘油磷脂水解產(chǎn)生脂肪酸的金屬鹽。如果用強(qiáng)堿水解,甘油磷脂水解生成脂肪酸鹽、醇(XOH)和磷酸甘油。b. 氧化作用:與三酰甘油相似,甘
44、油磷脂中所含的不飽和脂肪酸在空氣中能被氧化生成過氧化物,最終形成黑色過氧化物的聚合物。c. 酶解作用:甘油磷脂可被各種磷脂酶(PLA)專一水解。(3)鞘磷脂即鞘氨醇磷脂,在高等動物的腦髓鞘和紅細(xì)胞膜中特別豐富,也存在于許多植物種子中。鞘磷脂由鞘氨醇、脂肪酸和磷脂酰膽堿(少數(shù)磷脂酰乙醇胺)組成。. 糖脂是指糖基通過其半縮醛羥基以糖苷鍵與脂質(zhì)連接的化合物。糖脂可分為鞘糖脂、甘油糖脂以及由固醇衍生的糖脂,其中鞘糖脂和甘油糖脂是膜脂的主要成分。(1)鞘糖脂是神經(jīng)酰胺的1位羥基被糖基化形成的糖苷化合物。依據(jù)糖基是否含有唾液酸或硫酸基成分,鞘糖脂又可分為中性鞘糖脂和酸性鞘糖脂。中性鞘糖脂:又稱腦苷脂,是由
45、神經(jīng)酰胺的C1上的羥基與一單糖分子(半乳糖、葡萄糖等)以糖苷鍵結(jié)合而成,不含唾液酸成分。中性鞘糖脂一般為白色粉狀物,不溶于水、乙醚,溶于熱乙醇、熱丙酮、吡啶及苯等,性質(zhì)穩(wěn)定,不被皂化。它們不僅是血型抗原,而且與組織和器官的特異性,細(xì)胞之間的識別有關(guān)。酸性鞘糖脂:糖基部分含有唾液酸或硫酸基的鞘糖脂稱為酸性鞘糖脂。糖基部分含有唾液酸的鞘糖脂常稱神經(jīng)節(jié)苷脂,是最復(fù)雜的一類甘油鞘脂,由神經(jīng)酰胺與結(jié)構(gòu)復(fù)雜的寡糖結(jié)合而成,是大腦灰質(zhì)細(xì)胞膜的組分之一,也存在于脾、腎及其他器官中。(2)甘油糖脂是糖基二酰甘油,它是二酰甘油分子sn-3位上的羥基與糖基以糖苷鍵連接而成。甘油糖脂主要存在于植物和微生物中。植物的葉
46、綠體和微生物的質(zhì)膜含有大量的甘油糖脂。它可能在神經(jīng)髓鞘形成中起作用。. 固醇類也稱甾類,所有固醇類化合物都是以環(huán)戊烷多氫菲為核心結(jié)構(gòu),因羥基的構(gòu)型不同,可有及兩型。膽固醇(也稱膽甾醇)是一種重要的甾醇類物質(zhì),一種環(huán)戊烷多氫菲的衍生物。是動物組織中含量最豐富的固醇類化合物,有游離型和酯型兩種形式。存在于一切動物細(xì)胞中,以腦、神經(jīng)組織及腎上腺中含量特別豐富,其次為肝、腎、脾和皮膚及脂肪組織。4生物膜由哪些脂質(zhì)化合物組成的?各有何理化性質(zhì)?解答:組成生物膜的脂質(zhì)主要包括磷脂、固醇及糖脂。(1)磷脂:甘油磷脂,是生物膜的主要成分。是由sn-甘油-3-磷酸分子中甘油的兩個醇羥基與脂肪酸成酯,第三個醇羥基
47、與磷酸成酯或磷酸再與其他含羥基的物質(zhì)(如膽堿、乙醇胺、絲氨酸等醇類衍生物)結(jié)合成酯。物理性質(zhì):純的甘油磷脂是白色蠟狀固體,大多溶于含少量水的非極性溶劑中。用氯仿甲醇混合溶劑很容易將甘油磷脂從組織中提取出來。這類化合物又稱為兩性脂質(zhì)或稱極性脂質(zhì),具有極性頭和非極性尾兩個部分?;瘜W(xué)性質(zhì):a.水解作用:在弱堿溶液中,甘油磷脂水解產(chǎn)生脂肪酸的金屬鹽。強(qiáng)堿水解,生成脂肪酸鹽、醇(XOH)和磷酸甘油。b.氧化作用:甘油磷脂中所含的不飽和脂肪酸在空氣中能被氧化生成過氧化物,最終形成黑色過氧化物的聚合物。c.酶解作用:甘油磷脂可被各種磷脂酶(PLA)專一水解。鞘磷脂(SM):鞘磷脂由鞘氨醇、脂肪酸和磷脂酰膽堿
48、(少數(shù)為磷脂酰乙醇胺)組成。鞘磷脂為白色晶體,性質(zhì)穩(wěn)定,不溶于丙酮和乙醚,而溶于熱乙醇中,具兩性解離性質(zhì)。(2)固醇:高等植物的固醇主要為谷甾醇和豆甾醇。動物細(xì)胞膜的固醇最多的是膽固醇。膽固醇分子的一端有一極性頭部基團(tuán)羥基因而親水,分子的另一端具有羥鏈及固醇的環(huán)狀結(jié)構(gòu)而疏水。因此固醇與磷脂類化合物相似也屬于兩性分子。物理性質(zhì):膽固醇為白色斜方晶體,無味、無臭,熔點(diǎn)為148.5,高度真空條件下能被蒸餾。膽固醇不溶于水,易溶于乙醚、氯仿、苯、丙酮、熱乙醇、醋酸乙酯及膽汁酸鹽溶液中。介電常數(shù)高,不導(dǎo)電。化學(xué)性質(zhì):膽固醇C3上的羥基易與高級脂肪酸(如軟脂酸、硬脂酸及油酸等)結(jié)合形成膽固醇酯。膽固醇的雙
49、鍵可與氫、溴、碘等發(fā)生加成反應(yīng)。膽固醇可被氧化成一系列衍生物。膽固醇易與毛地黃糖苷結(jié)合而沉淀,這一特性可以用于膽固醇的定量測定。膽固醇的氯仿溶液與醋酸酐和濃硫酸反應(yīng),產(chǎn)生藍(lán)綠色(LiebermannBurchard反應(yīng))。 (3)糖脂:是指糖基通過其半縮醛羥基以糖苷鍵與脂質(zhì)連接的化合物。鞘糖脂和甘油糖脂是膜脂的主要成分。鞘糖脂:依據(jù)糖基是否含有唾液酸或硫酸基成分,鞘糖脂又可分為中性鞘糖脂和酸性鞘糖脂。中性鞘糖脂,是非極性的。鞘糖脂的疏水尾部伸入膜的脂雙層,極性糖基露在細(xì)胞表面,它們不僅是血型抗原,而且與組織和器官的特異性,細(xì)胞之間的識別有關(guān)。中性鞘糖脂一般為白色粉狀物,不溶于水、乙醚溶于熱乙醇
50、、熱丙酮、吡啶及苯等,性質(zhì)穩(wěn)定,不被皂化。酸性鞘糖脂,糖基部分含有唾液酸或硫酸基的鞘糖脂。糖基部分含有唾液酸的鞘糖脂常稱神經(jīng)節(jié)苷脂,不溶于乙醚、丙酮,微溶于乙醇,易溶于氯仿和乙醇的混合液。甘油糖脂:是糖基二酰甘油,它是二酰甘油分子sn-3位上的羥基與糖基以糖苷鍵連接而成。甘油糖脂主要存在于植物和微生物中。植物的葉綠體和微生物的質(zhì)膜含有大量的甘油糖脂。在哺乳動物組織中也檢測出了半乳糖基甘油酯,可能在神經(jīng)髓鞘形成中起作用。5何為必需脂肪酸?哺乳動物體內(nèi)所需的必需脂肪酸都有哪些?解答:哺乳動物體內(nèi)能夠自身合成飽和及單不飽和脂肪酸,但不能合成機(jī)體必需的亞油酸、亞麻酸和花生四烯酸等多不飽和脂肪酸。我們將
51、這些機(jī)體生長必需的而自身不能合成,必須由膳食提供的脂肪酸稱為必需脂肪酸。6何為生物膜?主要組成是什么?各有何作用?解答:任何細(xì)胞都以一層薄膜將其內(nèi)容物與環(huán)境分開,這層薄膜稱為細(xì)胞的質(zhì)膜。此外大多數(shù)細(xì)胞中還有許多內(nèi)膜系統(tǒng),它們組成具有各種特定功能的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)和細(xì)胞器如細(xì)胞核、線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、溶酶體、高爾基體、過氧化酶體等,在植物細(xì)胞中還有葉綠體。所有這些膜雖然組分和功能不同,但在電鏡下卻表現(xiàn)出大體相同的形態(tài)、厚度69nm的3片層結(jié)構(gòu)。這樣細(xì)胞的外周膜和內(nèi)膜系統(tǒng)稱為“生物膜”。(1) 膜脂:其中磷脂、糖脂、固醇等脂質(zhì)物質(zhì)都屬于兩性分子。當(dāng)磷脂分散于水相時,分子的疏水尾部傾向于聚集在一起,避開水相,
52、而親水頭部暴露在水相,形成具有雙分子層結(jié)構(gòu)的封閉囊泡,通稱為脂質(zhì)體。脂質(zhì)體的形成將細(xì)胞內(nèi)外環(huán)境分開。膜脂不但是構(gòu)成生物膜的重要物質(zhì)。而且與細(xì)胞識別、種的特異性、組織免疫性等有密切的關(guān)系。(2) 膜蛋白:對物質(zhì)代謝(酶蛋白)、物質(zhì)傳送、細(xì)胞運(yùn)動、信息的接受與傳遞、支持與保護(hù)均有重要意義。7一些藥物必須在進(jìn)入活細(xì)胞后才能發(fā)揮藥效,但它們中大多是帶電荷或有極性的,因此不能靠被動擴(kuò)散跨膜。人們發(fā)現(xiàn)利用脂質(zhì)體運(yùn)輸某些藥物進(jìn)入細(xì)胞是很有效的辦法,試解釋脂質(zhì)體是如何發(fā)揮作用的。解答:脂質(zhì)體是脂雙層膜組成的封閉的、內(nèi)部有空間的囊泡。離子和極性水溶性分子(包括許多藥物)被包裹在脂質(zhì)體的水溶性的內(nèi)部空間,負(fù)載有藥
53、物的脂質(zhì)體可以通過血液運(yùn)輸,然后與細(xì)胞的質(zhì)膜相融合將藥物釋放入細(xì)胞內(nèi)部。6 酶1作為生物催化劑,酶最重要的特點(diǎn)是什么?解答:作為生物催化劑,酶最重要的特點(diǎn)是具有很高的催化效率以及高度專一性。2酶分為哪幾大類?每一大類酶催化的化學(xué)反應(yīng)的特點(diǎn)是什么?請指出以下幾種酶分別屬于哪一大類酶:j 磷酸葡糖異構(gòu)酶(phosphoglucose isomerase)k 堿性磷酸酶(alkaline phosphatase)l 肌酸激酶(creatine kinase)m 甘油醛3磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)n 琥珀酰CoA合成酶(succiny
54、l-CoA synthetase)o 檸檬酸合酶(citrate synthase)p 葡萄糖氧化酶(glucose oxidase)q 谷丙轉(zhuǎn)氨酶(glutamic-pyruvic transaminase)r 蔗糖酶(invertase)s T4 RNA 連接酶(T4 RNA ligase)解答:前兩個問題參考本章第3節(jié)內(nèi)容。j 異構(gòu)酶類;k 水解酶類;l 轉(zhuǎn)移酶類;m 氧化還原酶類中的脫氫酶;n 合成酶類;o 裂合酶類;p 氧化還原酶類中的氧化酶;q 轉(zhuǎn)移酶類;r 水解酶類;s 合成酶類(又稱連接酶類)。3什么是誘導(dǎo)契合學(xué)說,該學(xué)說如何解釋酶的專一性?解答:“誘導(dǎo)契合”學(xué)說認(rèn)為酶分子的結(jié)
55、構(gòu)并非與底物分子正好互補(bǔ),而是具有一定的柔性,當(dāng)酶分子與底物分子靠近時,酶受底物分子誘導(dǎo),其構(gòu)象發(fā)生有利于與底物結(jié)合的變化,酶與底物在此基礎(chǔ)上互補(bǔ)契合進(jìn)行反應(yīng)。根據(jù)誘導(dǎo)契合學(xué)說,經(jīng)過誘導(dǎo)之后,酶與底物在結(jié)構(gòu)上的互補(bǔ)性是酶催化底物反應(yīng)的前提條件,酶只能與對應(yīng)的化合物契合,從而排斥了那些形狀、大小等不適合的化合物,因此酶對底物具有嚴(yán)格的選擇性,即酶具有高度專一性。4闡述酶活性部位的概念、組成與特點(diǎn)。解答:參考本章第5節(jié)內(nèi)容。5經(jīng)過多年的探索,你終于從一噬熱菌中純化得到一種蛋白水解酶,可用作洗衣粉的添加劑。接下來,你用定點(diǎn)誘變的方法研究了組成該酶的某些氨基酸殘基對酶活性的影響作用:(1)你將第65位
56、的精氨酸突變?yōu)楣劝彼幔l(fā)現(xiàn)該酶的底物專一性發(fā)生了較大的改變,試解釋原因;(2)你將第108位的絲氨酸突變?yōu)楸彼?,發(fā)現(xiàn)酶活力完全失去,試解釋原因;(3)你認(rèn)為第65位的精氨酸與第108位的絲氨酸在酶的空間結(jié)構(gòu)中是否相互靠近,為什么?解答:(1)第65位的氨基酸殘基可能位于酶活性部位中的底物結(jié)合部位,對酶的專一性有較大影響,當(dāng)該氨基酸殘基由精氨酸突變?yōu)楣劝彼岷?,其帶電性質(zhì)發(fā)生了改變,不再具有與原底物之間的互補(bǔ)性,導(dǎo)致酶的專一性發(fā)生改變。(2)第108位的絲氨酸殘基應(yīng)位于酶活性部位的催化部位,是決定酶是否有活力的關(guān)鍵氨基酸,通常它通過側(cè)鏈上的羥基起到共價催化的功能,當(dāng)該殘基突變?yōu)楸彼岷?,?cè)鏈羥基
57、被氫取代,不能再起原有的共價催化作用,因此酶活力完全失去。(3)第65位的精氨酸與第108位的絲氨酸在酶的空間結(jié)構(gòu)中應(yīng)相互靠近,因?yàn)檫@兩個氨基酸殘基都位于酶的活性部位,根據(jù)酶活性部位的特點(diǎn),參與組成酶活性部位的氨基酸殘基在酶的空間結(jié)構(gòu)中是相互靠近的。6酶具有高催化效率的分子機(jī)理是什么?解答:酶具有高催化效率的分子機(jī)理是:酶分子的活性部位結(jié)合底物形成酶底物復(fù)合物,在酶的幫助作用下(包括共價作用與非共價作用),底物進(jìn)入特定的過渡態(tài),由于形成此過渡態(tài)所需要的活化能遠(yuǎn)小于非酶促反應(yīng)所需要的活化能,因而反應(yīng)能夠順利進(jìn)行,形成產(chǎn)物并釋放出游離的酶,使其能夠參與其余底物的反應(yīng)。7利用底物形變和誘導(dǎo)契合的原理
58、,解釋酶催化底物反應(yīng)時,酶與底物的相互作用。解答:當(dāng)酶與底物互相接近時,在底物的誘導(dǎo)作用下,酶的構(gòu)象發(fā)生有利于底物結(jié)合的變化,與此同時,酶中某些基團(tuán)或離子可以使底物分子中圍繞其敏感鍵發(fā)生形變。酶與底物同時發(fā)生變化的結(jié)果是酶與底物形成一個互相契合的復(fù)合物,并進(jìn)一步轉(zhuǎn)換成過渡態(tài)形式,在過渡態(tài)形式中,酶活性部位的構(gòu)象與底物過渡態(tài)構(gòu)象十分吻合,從而降低活化能,增加底物的反應(yīng)速率。8簡述酶促反應(yīng)酸堿催化與共價催化的分子機(jī)理。解答:在酶促反應(yīng)酸堿催化中,酶活性部位的一些功能基團(tuán)可以作為廣義酸給出質(zhì)子(例如谷氨酸殘基不帶電荷的側(cè)鏈羧基、賴氨酸殘基帶正電荷的側(cè)鏈氨基等),底物結(jié)合質(zhì)子,形成特定的過渡態(tài),由于形
59、成該過渡態(tài)所需活化能相比于非酶促反應(yīng)更低,因此反應(yīng)速率加快;另外一些功能基團(tuán)可以作為廣義堿從底物接受質(zhì)子(例如谷氨酸殘基帶負(fù)電荷的側(cè)鏈羧基、賴氨酸殘基不帶電荷的側(cè)鏈氨基等),底物失去質(zhì)子后,形成過渡態(tài)所需的活化能比非酶促反應(yīng)低,因此反應(yīng)速率加快。在酶促反應(yīng)共價催化中,酶活性部位的一些功能基團(tuán)作為親核試劑作用于底物的缺電子中心,或者作為親電試劑作用于底物的負(fù)電中心,導(dǎo)致酶底物共價復(fù)合物的形成,該共價復(fù)合物隨后被第二種底物(在水解反應(yīng)中通常是水分子)攻擊,形成產(chǎn)物與游離酶。由于該共價復(fù)合物形成與分解的反應(yīng)所需活化能均比非酶促反應(yīng)低,因此反應(yīng)速率被加快。9解釋中間絡(luò)合物學(xué)說和穩(wěn)態(tài)理論,并推導(dǎo)修正后的
60、米氏方程。解答:參考本章第6節(jié)內(nèi)容。10乙醇脫氫酶催化如下反應(yīng):(1)已知反應(yīng)體系中NADH在340nm有吸收峰,其他物質(zhì)在該波長處的吸光度均接近于零,請設(shè)計一種測定酶活力的方法。(2)如何確定在實(shí)驗(yàn)中測得的酶促反應(yīng)速率是真正的初速率?(3)在實(shí)驗(yàn)中使用了一種抑制劑,下表中是在分別存在與不存在抑制劑I的情況下測定的對應(yīng)不同底物濃度的酶促反應(yīng)速率,請利用表中的數(shù)據(jù)計算其各自對應(yīng)的Km與Vmax值,并判斷抑制劑的類型。S/(mmol/L)v/ (mmolL-1min-1)I = 0I = 10 mmol/L205.2633.999155.0013.636104.7623.22254.2642.11
61、52.53.3331.3161.62.770.926解答:(1)選擇合適的底物濃度(NAD+與乙醇)與緩沖體系,取一定體積的底物溶液(如1ml)加入石英比色杯,加入適量酶,迅速混合后,放入紫外/可見光分光光度計的樣品室內(nèi),測定反應(yīng)體系在340 nm吸光度隨時間的變化曲線。利用NADH的摩爾吸光系數(shù)(可從相關(guān)文獻(xiàn)查到,或用已知濃度的NADH溶液自行測定),計算出單位時間內(nèi)NADH的增加量,用于表示酶活力。(2)如果在選取的測量時間范圍內(nèi),反應(yīng)體系在340 nm吸光度隨時間的變化曲線接近一條直線的形狀,則表明反應(yīng)速率在此時間段內(nèi)保持不變,可用來代表反應(yīng)初速率。(3)用Lineweaver-Burk
62、雙倒數(shù)作圖法,結(jié)果如下:Km與Vmax值抑制劑濃度I = 0I = 10 mmol/LKm/(mmolL-1)1.643 8.244Vmax/(mmolL-1min-1)5.645.64抑制劑的類型:競爭性可逆抑制劑。11對于一個符合米氏方程的酶,當(dāng)S=3Km,I=2KI時(I為非競爭性抑制劑),則/Vmax的數(shù)值是多少(此處Vmax指I=0時對應(yīng)的最大反應(yīng)速率)?解答:利用非競爭性抑制劑的動力學(xué)方程計算:其中a = 1+I/Ki = 3,則所以,/Vmax0.25。12試通過一種反競爭性抑制劑的動力學(xué)分析解釋其抑制常數(shù)KI在數(shù)值上是否可能等于該抑制劑的IC50(IC50即酶的活力被抑制一半時的抑制劑濃度,假設(shè)酶濃度與底物濃度均固定不變)。解答:令v0為不存在抑制劑時的酶促反應(yīng)速率,vi是存在反競爭性抑制劑時的反應(yīng)速率,則當(dāng)I=IC50時,酶活力被抑制一半,vi=v0/2。由于 因此Km = (a-2)S如果KI在數(shù)值上等于IC50,則a = 2,a-2 = 0,Km = 0,而實(shí)際上,Km并不為零。因此KI在數(shù)值上不可能等于IC50。13在生物體內(nèi)存在很多通過改變酶的結(jié)構(gòu)從而調(diào)節(jié)其活性的方法
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