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Western Blot 常見(jiàn)問(wèn)題分析

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1、Western Blot 常見(jiàn)問(wèn)題分析 8 t W5 _0 U6 |: U, ]$ b; d) O1. 在western實(shí)驗(yàn)中,通常有人采用TBS,有人采用PBS,能否有人解釋一下二者在使用中的區(qū)別? ; e2 Q8 R, H& o! @1 A4 u: @  選擇合適的緩沖液對(duì)于維持一定PH值下蛋白質(zhì)的穩(wěn)定及保證實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性是很重要的。PBS的緩沖能力強(qiáng)于TBS(因?yàn)榛旌暇彌_液在一定的離子強(qiáng)度下常常具有更寬的緩沖范圍),TBS在PH7.0以下緩沖能力較弱(不過(guò)PBS易污染)。但我們常常要根據(jù)我們實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x用合適的緩沖液,如在蛋白純化中進(jìn)行陰離子交換層析,陽(yáng)離子緩沖液首選TBS;陽(yáng)

2、離子交換層析時(shí),陰離子緩沖液則首選PBS。: Y0 g" l9 S) O' p8 u western blot中使用TBS和PBS均可,只是要根據(jù)需要選擇合適的濃度。6 p) e4 c- U: n/ i/ E; | 2. 沒(méi)有注明可以用來(lái)做western blot的一抗,可以用來(lái)做western blot嗎?1 r' @. k n/ J 不一定,因?yàn)橛械目贵w是識(shí)別線性表位的,有的是識(shí)別構(gòu)象型表位的,識(shí)別構(gòu)象型表位的抗體不能用于western blotting,因?yàn)樵趙estern blotting中抗體識(shí)別的是完全變性的蛋白質(zhì)抗原,而蛋白質(zhì)抗原的構(gòu)象型表位變性時(shí)被破壞。# Y8

3、y5 S% t, g4 d6 ^+ w 3. 做western每次只加一種一抗,可以同時(shí)加兩種或者多種一抗的嗎? ; u5 D* p- |: O0 ?9 D  最好還是不要同時(shí)加兩種一抗。因?yàn)槿绻Y(jié)果里面有非特異信號(hào)的話,就說(shuō)不清楚了。做Western在同一張膜上檢測(cè)目的蛋白和內(nèi)對(duì)照,也是先上目的蛋白的一抗、二抗,ECL顯色、壓片、洗片;漂洗以后,再上內(nèi)對(duì)照的一抗、二抗,ECL顯色、壓片、洗片。 + B% W1 U3 c' C2 O; O4. western blot 使用的膜哪種最好啊,PVDF好還是NC膜,能介紹一下膜的選擇嗎?" m) ~/ c) t4 `! h4 ]* W5

4、H   PVDF膜價(jià)格較貴,可重復(fù)使用,特別適合蛋白印跡,結(jié)合能力較強(qiáng),但價(jià)格比較昂貴。 NC膜價(jià)格比較便宜,應(yīng)用較廣,結(jié)合牢固性差一些,韌性也不如PVDF,不能重復(fù)使用,但蛋白吸附容量高,親水性較好。 都可以用麗春紅染色。具體使用還要參考相關(guān)文獻(xiàn)。* x# r7 U( T/ u1 {5 m8 Y* X+ i1 O( b 5. 為什么出現(xiàn)了多條帶,每個(gè)加樣槽中都出現(xiàn)了多條帶,而且好象都很有規(guī)律,為什么?是封閉時(shí)間不夠嗎?做WESTERN必須要內(nèi)參嗎? 5 v I) i" _; H9 ~" r( C, l  一抗、或二抗抗體濃度太高,多克隆抗體本身的非特異性反應(yīng),抗體的特異性不強(qiáng),目的

5、蛋白經(jīng)過(guò)處理后發(fā)生變化,而內(nèi)參的條帶基本均勻一致.這樣才有說(shuō)服力,表明的確是處理因素造成目的蛋白的變化而不是加樣誤差或認(rèn)為的造成目的條帶濃度的變化.所以嚴(yán)格意義上說(shuō),內(nèi)參是必須做的。 9 z. z! g3 b, \0 \6. western用的一抗,單抗好些還是用多抗好些?購(gòu)買(mǎi)一抗時(shí)發(fā)現(xiàn)單抗(用于western)比多抗(用于western和ELISA)要便宜不少,用于western的抗體和用于ELISA的抗體有什么不同的要求? 9 ^4 S8 Q8 k; D& g  作為western來(lái)講,理論上單抗比多抗的特異性要好,但單抗種類(lèi)較少一般價(jià)格偏高,所以一般來(lái)說(shuō)多抗足夠了。用于western

6、的抗體和用于ELISA的抗體,一般來(lái)說(shuō)用于western的抗體識(shí)別的是氨基酸序列特異性;而可用于ELISA的抗體則要看抗原種類(lèi),有些是識(shí)別氨基酸序列特異性,有些是識(shí)別構(gòu)像特異性。所以一般根據(jù)抗體說(shuō)明書(shū)來(lái)確定。 * C7 ^# A( A% }" T4 M  做免疫印跡時(shí)選擇抗體主要應(yīng)考慮兩個(gè)問(wèn)題,一是所選抗體是否能識(shí)別凝膠電泳后轉(zhuǎn)印至膜上的變性蛋白,另一個(gè)是所選抗體是否會(huì)引起交叉反應(yīng)條帶。 0 V( ]: F" S- l4 z- v& a: A7. 半干轉(zhuǎn)是否要求膜,濾紙,膠同樣大小?因?yàn)槟z大小不一定規(guī)則,膜和濾紙會(huì)大一點(diǎn),那樣會(huì)不會(huì)短路?什么是短路?如何控制和發(fā)現(xiàn)短路呢?% h3 @! S

7、* l9 L- J' _! ~   可以相等,但是如果紙、膜比凝膠大就比較容易形成短路了,上下兩層慮紙也不能因過(guò)大而相互接觸,這樣同樣會(huì)短路,電流不會(huì)通過(guò)膠和慮紙。轉(zhuǎn)移前和轉(zhuǎn)移過(guò)程中看看電壓就行,正常的半干是慢慢變高的, 最后結(jié)束時(shí)一般是開(kāi)始的1.5-3倍都是正常的。一般Buffer和濾紙選的對(duì)就不會(huì)短路。$ Z" ?8 [2 C* Y$ @) s 8. Western Blot哪種染色好?8 m4 ]$ |' Y+ \$ n7 ?4 v1 o6 M μg,考馬斯亮藍(lán)雖然與氨基黑有相同的靈敏度,但脫色慢,背景高。麗春紅S和快綠在檢測(cè)后容易從蛋白質(zhì)中除去 ,以便進(jìn)行隨后的氨基酸分析。缺點(diǎn)是

8、:溶劑系統(tǒng)的甲醇會(huì)引起硝化纖維素膜的 皺縮或破壞。不能用語(yǔ)正電賀的膜。靈敏度低。 - `$ a4 ~7 J# G" r, v7 v3 \. }; J(2) 膠體金,靈敏度高,檢測(cè)范圍可到pg級(jí),但染色比穩(wěn)定。 1 b" n: o W X1 q/ ]& x$ [& J(3) 生物素化靈敏度位于1、2之間,可用于任何一種膜。2 n9 ~( P! f9 E* _' b2 M 9. 不能很好地將大分子量蛋白轉(zhuǎn)移到膜上, 轉(zhuǎn)移效率低怎么樣解決?/ N" M9 ]% l1 p5 P" T   可以考慮:轉(zhuǎn)移緩沖液中加入20%甲醇(是指終濃度)(優(yōu)化的轉(zhuǎn)移緩沖液,可以參考《蛋白質(zhì)技術(shù)手冊(cè)》),因

9、為甲醇可降低蛋白質(zhì)洗脫效率,但可增加蛋白質(zhì)和NC膜的結(jié)合能力,甲醇可以防止凝膠變形,甲醇對(duì)高分子量蛋白質(zhì)可延長(zhǎng)轉(zhuǎn)移時(shí)間;轉(zhuǎn)移緩沖液加入終濃度0.1%SDS,也是為了增加轉(zhuǎn)移效率;用優(yōu)質(zhì)的轉(zhuǎn)移膜,或使用小孔徑的NC膜(0.2微米);使用戊二醛交聯(lián);低濃度膠,如低至6%。太大時(shí)還可以考慮用瓊脂糖膠;提高轉(zhuǎn)移電壓/電流;增加轉(zhuǎn)移時(shí)間。 5 U* v' P: G$ Q# m0 P2 ]& x10. DAB顯色、堿性磷酸酶-抗堿性磷酸酶顯色原理是什么?0 _$ Z+ a$ f2 g4 T DAB顯色在辣根過(guò)氧化酶的作用能形成一種灰褐色的終末產(chǎn)物,該產(chǎn)物難溶于醇和其他有機(jī)溶劑,DAB的

10、氧化還能引起聚合作用,導(dǎo)致與四氧化鋨反應(yīng)而增加其染色強(qiáng)度和電子密度。堿性磷酸酶-抗堿性磷酸酶顯色中,酶將奈酚磷酸(底物)水解成酚類(lèi)和磷酸。酚和無(wú)色的重氮鹽(顯色原)結(jié)合而產(chǎn)生有色的、不溶性偶氮染料。 0 r$ d( U0 U" p( e4 {11. 酶顯色與熒光顯色之間,各自的優(yōu)缺點(diǎn)是什么? / E$ ^% k7 H# l, |# h- H( l  免疫酶技術(shù)就是用酶(如辣根過(guò)氧化物酶)標(biāo)記已知抗體(或抗原),然后與組織標(biāo)本在一定條件下反應(yīng),如果組織中含有相應(yīng)抗原(或抗體),抗原抗體相互結(jié)合形成的復(fù)合物中所帶酶分子遇到底物時(shí),能催化底物水解、氧化或還原,產(chǎn)生顯色反應(yīng),這樣就可以識(shí)別出標(biāo)本抗

11、原(抗體)分布的位置和性質(zhì),通過(guò)圖像分析并可達(dá)到定量的目的。 , Q8 c5 ~6 P" t$ E0 d6 V  免疫熒光技術(shù)雖已廣泛應(yīng)用于免疫學(xué)的研究與診斷,但是熒光抗體染色標(biāo)本不能長(zhǎng)期保存,對(duì)組織細(xì)胞的細(xì)微結(jié)構(gòu)分辨不清,免疫酶技術(shù)則能克服上述不足,標(biāo)記免疫酶技術(shù)的敏感性更優(yōu)于免疫熒光法,對(duì)石蠟切片標(biāo)本尤為適用,為免疫病理研究開(kāi)辟了一條新途徑,酶顯色產(chǎn)物具有較高的電子密度,經(jīng)過(guò)適當(dāng)處理還可以進(jìn)行免疫電鏡觀察,免疫酶組化技術(shù)分為酶標(biāo)記法與非標(biāo)記抗體技術(shù),前者是將酶通過(guò)交聯(lián)劑結(jié)合在抗體分子上,形成酶標(biāo)記抗體。后者是將酶作為抗原與相應(yīng)的特異性抗體連接進(jìn)行的免疫反應(yīng),稱(chēng)為非標(biāo)記抗體酶技術(shù)。

12、關(guān)于western blot原理和常見(jiàn)故障分析(我覺(jué)的比較全) 關(guān)于western blot 原理: 通過(guò)電泳區(qū)分不同的組分,并轉(zhuǎn)移至固相支持物,通過(guò)特異性試劑(抗體)作為探針,對(duì)靶物質(zhì)進(jìn)行檢測(cè),蛋白質(zhì)的Western印跡技術(shù)結(jié)合了凝膠電泳的高分辨率和固相免疫測(cè)定的特異敏感等多種特點(diǎn),可檢測(cè)到低至1~5ng(最低可到10-100pg)中等大小的靶蛋白。 一、抗原的選擇和制備 A:樣品的制備 1 組織: 組織的處理方法:組織洗滌后加入3倍體積預(yù)冷的PBS,0℃研磨,加入5×STOP buffer,180W,6mins,0℃超聲波破碎,5000rpm,5mins 離心,取上清

13、。加入β-ME(9.5ml加入0.5ml),溴酚藍(lán)(9.5ml加入0.5ml)煮沸10min,分裝后于-20℃保存,用時(shí)取出,直接溶解上樣。 2 細(xì)胞: 細(xì)胞的處理方法: 離心收集細(xì)胞或者直接往細(xì)胞培養(yǎng)瓶?jī)?nèi)加入5×STOP buffer,收集,180W,6mins,0℃超聲波破碎,5000rpm,5mins 離心,取上清。加入β-ME(9.5ml加入0.5ml),溴酚藍(lán)(9.5ml加入0.5ml)煮沸10min,分裝后于-20℃保存,用時(shí)取出,直接溶解上樣。 3 分泌蛋白的提取(特例): 直接收集分泌液,加入β-ME、溴酚藍(lán)制樣。 B:蛋白的定量方法及影響蛋白定量原因 1.雙縮脲法

14、: 雙縮脲法是第一個(gè)用比色法測(cè)定蛋白質(zhì)濃度的方法。在需要快速,但不很準(zhǔn)確的測(cè)定中,常用此法。硫銨不干擾顯色,這對(duì)蛋白質(zhì)提純的早期階段是非常有利的。雙縮脲法的原理是Cu2+與蛋白質(zhì)的肽鍵,以及酪氨酸殘基絡(luò)合,形成紫藍(lán)色絡(luò)合物,此物在540nm波長(zhǎng)處有最大吸收。雙縮脲法常用于0.5g/L~10g/L含量的蛋白質(zhì)溶液測(cè)定。干擾物有硫醇,以及具有肽性質(zhì)緩沖液,如Tris、Good緩沖液等??捎贸恋矸ǔジ蓴_物,即用等體積10%冷的三氯醋酸沉淀蛋白質(zhì),然后棄去上清液,再用已知體積的1m NaOH溶解沉淀的蛋白質(zhì)進(jìn)行定量測(cè)定。 2.Lowry法: 此法是雙縮脲法的進(jìn)一步發(fā)展。他的第一步就是雙縮脲反應(yīng)

15、,即Cu++與蛋白質(zhì)在堿性溶液中形成絡(luò)合物,然后這個(gè)絡(luò)合物還原磷鉬磷-磷鎢酸試劑(福林-酚試劑),結(jié)果得到深藍(lán)色物。此法比雙縮脲法靈敏得多,適合于測(cè)定20mg/L~400mg/L含量的蛋白質(zhì)溶液。其干擾物質(zhì)與雙縮脲法相同,而且受他們的影響更大,硫醇和許多其他物質(zhì)的存在會(huì)使結(jié)果嚴(yán)重偏差。另外要注意的是,加入福林試劑時(shí)要特別小心,試劑只在酸性pH環(huán)境中才穩(wěn)定,上述提到的還原反應(yīng)只有在pH10時(shí)才發(fā)生,因此,福林試劑加入到堿性的Cu2+-蛋白質(zhì)溶液中時(shí),必須立刻攪拌,以使磷鉬酸-磷鎢酸試劑在未被破壞之前能有效地被Cu2+-蛋白質(zhì)絡(luò)合物所還原。 3.紫外吸收法: 大多數(shù)蛋白質(zhì)在280nm波長(zhǎng)處有特

16、征的最大吸收,這是由于蛋白質(zhì)中有酪氨酸,色氨酸和苯丙氨酸存在的緣故,因此,利用這個(gè)特異性吸收,可以計(jì)算蛋白質(zhì)的含量。如果沒(méi)有干擾物質(zhì)的存在,在280nm處的吸收可用于測(cè)定0.1~0.5mg/ml含量的蛋白質(zhì)溶液。部分純化的蛋白質(zhì)常含有核酸,核酸在260nm波長(zhǎng)處有最大吸收。 4. Bradford比色法: Bradford比色法比Lowry法測(cè)定蛋白濃度更簡(jiǎn)單迅速。用脫氧膽酸/三氯乙酸沉淀蛋白可排除甘油、去污劑、2-巰基乙醇、乙酸、硫酸銨、Tris和一些堿性緩沖系統(tǒng)的干擾。 分別在兩組微量離心管中各加入0.5mg/ml牛血清白蛋白(5,10,15和20μμl,同時(shí)以?xún)晒?00μl的0.1

17、5mmol/l NaCl作空白對(duì)照。每管各加入1ml考馬斯亮藍(lán)染料溶液,振蕩混勻,室溫放置2分鐘。用1cm光徑的微量比色杯測(cè)A595,取A595吸光值對(duì)標(biāo)準(zhǔn)蛋白濃度作圖,畫(huà)標(biāo)準(zhǔn)曲線,并測(cè)量待測(cè)樣品的A595。從BSA標(biāo)準(zhǔn)曲線中確定待測(cè)樣品的濃度。測(cè)定10-100μg的蛋白質(zhì),要在較大試管中將染料溶液體積增大5倍進(jìn)行。樣品濃度過(guò)高,可稀釋后進(jìn)行,或在10-100μg另作一標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行測(cè)定。 5.電泳估算法(我們選擇此法): 樣品倍比稀釋?zhuān)琒DS-PAGE電泳,同時(shí)做定量marker對(duì)照,可以估算樣品大概濃度。 以提取癌組織總蛋白為例: ① 取等量胰腺癌組織、癌旁組織及正常胰腺組織,用dH

18、2O漂洗5~10次,再用預(yù)冷的1×PBS洗滌3次,目的是去除樣本中的血液。 ② 每2克組織加入3ml 1×PBS勻漿,保持在4℃條件進(jìn)行。 ③ 加入5×STOP Buffer緩沖液1ml,混勻,4℃下超聲碎化。再加入0.5ml β-ME,0.5ml溴酚藍(lán),煮沸10mins,至此,制樣過(guò)程完成; ④ SDS-PAGE電泳,以BAS作為對(duì)照估計(jì)樣品蛋白濃度。 二、SDS-聚丙烯酸胺凝膠電泳(SDS-PAGE) A:實(shí)際操作 1. 做膠前的準(zhǔn)備 1)檢查是否有足夠的、干凈的 spacer、comb 和架子。 2)檢查是否有新鮮的,足量10%APS,沒(méi)有立刻重配。 3)按將要檢測(cè)的抗

19、體對(duì)應(yīng)的原始抗原的分子量大小,計(jì)算出膠的濃度,并算出分離膠各組分的用量。 2. 制膠,電泳 1)裝好架子。 2)按照下面配方配制分離膠。(單位:ml,Total: 8ml) 7.5% 10% 15% 2×Sep. buffer 4 4 4 30% Gel.sol 2.0 2.7 4 ddH2O 1.9 1.2 0 TEMED 8ul 8ul 8ul 10%APS 80ul 0ul 80ul 在膠上面加入一層蒸餾水,促進(jìn)膠更好的凝集。 3)待分離膠凝集后,配制濃縮膠。(單位:ml,Tota

20、l: 3.5ml) 3% TEMED 5ul 10%APS 50ul 倒好后插入預(yù)先準(zhǔn)備好的梳子。 4)待膠凝集好后,上樣,電泳。 上層膠用60-80V電壓,當(dāng)樣品至分離膠時(shí),用100-120V電壓。一般電泳時(shí)間在1.5小時(shí)左右。 B :注意事項(xiàng)及常遇到的問(wèn)題 1)分離膠不要倒的太滿(mǎn),需要有一定的濃縮膠空間,否則起不到濃縮效果。 2)上樣蛋白量不應(yīng)超過(guò)30ug/mm2 (載荷面即:如果你的膠槽是5mm×1mm,則載荷面為:1mm×5mm=5mm2) 。 3)gel通常在0.5-1h內(nèi)凝集最好,過(guò)快表示TEMED、APS用量過(guò)多,此時(shí)膠太硬易龜裂,而且電泳時(shí)容易燒膠

21、。太慢則說(shuō)明兩種試劑用量不夠或者系統(tǒng)實(shí)際不純或?qū)嵭А? 4)混合攪拌速度太快產(chǎn)生氣泡影響聚合,導(dǎo)致電泳帶畸形。太慢不均勻,特別是甘油。 5)電泳中常出現(xiàn)的一些現(xiàn)象: ︶ 條帶呈笑臉狀,原因:凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好。 ︵ 條帶呈皺眉狀,可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不完全。 拖尾:樣品溶解不好。 紋理(縱向條紋):樣品中含有不溶性顆粒。 條帶偏斜:電極不平衡或者加樣位置偏斜。 條帶兩邊擴(kuò)散:加樣量過(guò)多。 三、轉(zhuǎn)移 在電流的作用下,使蛋白質(zhì)從膠轉(zhuǎn)移至固相載體(膜)上。 膜的選擇:印跡中常用的固相材料有NC膜、DBM、DDT、尼龍膜、

22、PVDF等。我們選用PVDF(聚偏二氟乙烯),其具有更好的蛋白吸附、物理強(qiáng)度,以及具有更好的化學(xué)兼容性。有兩種規(guī)格:Immobilon-P(0.45um)和Immobilon-PSQ(0.2um for MW<20kDa)。 A 半干法 即將凝膠夾層組合放在吸有轉(zhuǎn)印緩沖液的濾紙之間,通過(guò)濾紙上吸附的緩沖液傳導(dǎo)電流,起到轉(zhuǎn)移的效果。因?yàn)殡娏髦苯幼饔迷谀つz上,所以其轉(zhuǎn)移條件比較嚴(yán)酷,但是其轉(zhuǎn)移時(shí)間短,效率高。 1 實(shí)驗(yàn)條件的選擇 電流1mA-2mA/cm2,我們通常100mA/膜,按照目的蛋白分子大小、膠濃度選擇轉(zhuǎn)移時(shí)間,具體可以根據(jù)實(shí)際適當(dāng)調(diào)整。 目的蛋白分子大小(kDa) 膠濃度 轉(zhuǎn)

23、移時(shí)間 25---80 2 實(shí)驗(yàn)操作 (1)濾紙和膜的準(zhǔn)備 (在電泳結(jié)束前20分鐘應(yīng)開(kāi)始準(zhǔn)備工作)。 A. 檢查是否有足夠的transfer buffer,沒(méi)有立即配制。 B. 檢查是否有合適大小的濾紙和膜。 C. 將膜泡入甲醇中,約1-2分鐘。再轉(zhuǎn)入transfer buffer中。 D. 將合適的靠膠濾紙和靠膜濾紙分別泡入transfer buffer 中。 PDVF膜在進(jìn)轉(zhuǎn)移緩沖液時(shí),要在甲醇里面泡多長(zhǎng)時(shí)間? PVDF是疏水性的,在轉(zhuǎn)膜緩沖液里很難浸透,甲醇處理后使更容易浸潤(rùn)。 PVDF的預(yù)處理是用甲醇浸泡活化,浸泡透之后轉(zhuǎn)入蒸餾水洗

24、兩次。用甲醇泡的目的是為了活化PVDF膜上面的正電基團(tuán),使它更容易跟帶負(fù)電的蛋白質(zhì)結(jié)合。 一般5-20分鐘都有人在用??稍谌∧z的同時(shí)泡,估計(jì)前后5分鐘左右。效果還不錯(cuò)。以前有站友發(fā)貼,說(shuō)處理時(shí)間沒(méi)多大關(guān)系,關(guān)鍵看膜的質(zhì)量.確實(shí)是這樣的。只要讓膜完全浸透應(yīng)該就沒(méi)問(wèn)題了。 Hybond的PVDF說(shuō)明書(shū)這樣的寫(xiě)的:“pre-wet the membrane in 100% methanol (10 seconds)”。 我的理解是,至少10秒鐘,多泡下也沒(méi)關(guān)系的,事實(shí)上,泡10秒的做過(guò),10分鐘的也做過(guò),都沒(méi)有問(wèn)題的。 (2)轉(zhuǎn)移 A. 在電轉(zhuǎn)移儀上鋪好下層濾紙。一般用三層。 B.

25、 將膜鋪在靠膜濾紙上,注意和濾紙間不要有氣泡,再倒一些transfer buffer到膜上,保持膜的濕潤(rùn)。 C. 將膠剝出,去掉stack gel,小心的移到膜上。 D. 剪去膜的左上角,在膜上用鉛筆標(biāo)記出膠的位置。 E. 將一張靠膠濾紙覆蓋在膠上。 倒上些transfer buffer,再鋪兩張靠膠濾紙。 F. 裝好電轉(zhuǎn)移儀,根據(jù)需要選定所需的電流和時(shí)間。 G. 轉(zhuǎn)移過(guò)程中要隨時(shí)觀察電壓的變化,如有異常應(yīng)及時(shí)調(diào)整。 3 注意事項(xiàng)及常遇到的問(wèn)題 1)濾紙、膠、膜之間的大小,一般是濾紙>=膜>=膠。 2)濾紙、膠、膜之間千萬(wàn)不能有氣泡,氣泡會(huì)造成短路。 3)因?yàn)槟さ氖杷裕?/p>

26、膜必須首先在甲醇中完全浸濕。而且在以后的操作中,膜也必須隨時(shí)保持濕潤(rùn)(干膜法除外)。 4)濾紙可以重復(fù)利用,上層濾紙(靠膜)內(nèi)吸附有很多轉(zhuǎn)移透過(guò)的蛋白質(zhì),所以上下濾紙一定不能弄混,在不能分辨的情況下,可以將靠膠濾紙換新的。 5)轉(zhuǎn)移時(shí)間一般為1.5 小時(shí),( 1mA-2mA/cm2,10% gel),可根據(jù)分子量大小調(diào)整轉(zhuǎn)移時(shí)間和電流大小。 1)在疊膜、膠、紙三明治時(shí)候,操作于盛有轉(zhuǎn)膜Buffer的大平皿中進(jìn)行,疊好后,再將三者平行轉(zhuǎn)移至轉(zhuǎn)膜裝置,切勿再移動(dòng),因?yàn)樵赽uffer中操作,已經(jīng)完全排除了氣泡存在的可能,無(wú)需再趕氣泡 2)關(guān)于轉(zhuǎn)膜時(shí)間:半干轉(zhuǎn)的話,20 V×30min即可

27、 B 濕法 我們基本上不用此方法,這里暫不做介紹。 C 轉(zhuǎn)移后效果的鑒定 1.染膠 用考馬斯亮蘭染色經(jīng)destain脫色后,看膠上是否還有蛋白來(lái)反映轉(zhuǎn)移的效果。 2.染膜 有兩類(lèi)染液選擇,可逆的和不可逆的。可逆的有ponceau-s red 、Fastgreen FC、CPTS等,這類(lèi)染料染色后,色素可以被洗掉,膜可以用做進(jìn)一步的分析用。但是不可逆的染料,如考馬斯亮蘭、india ink、Amido.black 10B等,染色后膜就不能用于進(jìn)一步的分析。 四、封閉(block) 封閉是為了使我們的抗體僅僅只能跟特異的蛋白質(zhì)結(jié)合而不是和膜結(jié)合。 常用的封閉液有bovine s

28、erum albumin(BSA),non-fat milk,casein,gelatin,tween-20等,我們一般用non-fat milk。 在轉(zhuǎn)移結(jié)束前配好5%的Milk(TBST溶解)。轉(zhuǎn)移結(jié)束后將膜放入milk中block(一定要放在干凈的容器里,避免污染而且要足以覆蓋膜),并清洗整理好用過(guò)的濾紙,以便下次使用。 Block 4°C O/N,或 RT 1小時(shí)。 封閉后可以不洗膜,讓膜的一角在吸水紙上接觸,把封閉液控一下即可 五、孵育一抗 A. 先將需要檢測(cè)的抗體準(zhǔn)備好,并決定好它們的稀釋度。 B. 配好5%的Milk(TBST溶解),按要求稀釋好抗體。注意,如需高比例稀

29、釋?zhuān)? 最好采用梯度稀釋。 C. 將稀釋好的抗體和膜一起孵育。 一般采用RT 1小時(shí),可根據(jù)抗體量和膜上 抗原量適當(dāng)延長(zhǎng)或縮短時(shí)間。 注意:為了便于后面分析結(jié)果,我們一般會(huì)選用已確定分子量大小而且純度高的抗體作為marker與一抗同時(shí)孵育。 六、洗滌 用 TBST先快速洗三次,把milk盡快的wash掉。然后5mins *5。 洗滌是為了洗去一抗與抗原的非特異性結(jié)合,洗滌的效果直接影響結(jié)果背景的深淺。 七、孵育二抗 孵育 RT1 小時(shí)。 一般采用HRP標(biāo)記的二抗,稀釋比例為1:5000。 二抗的稀釋比例不能太低,否則容易導(dǎo)致非特異性的結(jié)合。 注意二抗的選擇有多種,

30、要根據(jù)一抗來(lái)選擇抗兔、抗鼠或者抗羊的二抗,以及根據(jù)后面的顯色條件來(lái)選擇HRP、AP或者GOD(葡萄糖氧化酶)酶鏈的二抗或者標(biāo)志其他探針(如核素等)的。 八、洗滌 用 TBST先快速洗三次,把milk盡快的wash掉。 然后5mins *5。 洗滌是為了洗去二抗的非特異性結(jié)合,洗滌的效果直接影響結(jié)果背景的深淺,所以洗滌一定要干凈。 九、顯色(HRP酶) 1.增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光法(ECL) Ecl 顯色原理:氨基苯二酰肼類(lèi)主要是魯米諾及異魯米諾衍生物,是最常用的一類(lèi)化學(xué)發(fā)光劑。魯米諾(luminol,5'-氨基-2,3-二氫-1,4-酞嗪二酮)的分子結(jié)構(gòu)及化學(xué)反應(yīng)式如下:   

31、魯米諾在免疫測(cè)定中既可用作標(biāo)記物,也可用作過(guò)氧化物酶的底物。在Ecl底物中,含有H2O2和魯米諾,在HRP(辣根過(guò)氧化物酶)的作用下,發(fā)出熒光來(lái)。 試驗(yàn)步驟: 1)將兩種顯色底物1:1等體積混合(一般各1ml/membrane)。 2)將混合物覆蓋在膜表面,1-2分鐘,搖晃使均勻。 3)用保鮮膜把膜包起來(lái),放入夾板中。 4)在暗室中將X光片,覆蓋在膜的上面,夾好夾子,曝光1min。 5)顯影、定影。 6)根據(jù)結(jié)果調(diào)整曝光時(shí)間和曝光區(qū)域,得到最佳結(jié)果。 注意:熒光在一段時(shí)間后會(huì)越來(lái)越弱。 DAB(3,3二氨基聯(lián)苯胺)和HRP反應(yīng)產(chǎn)生棕色的不溶終產(chǎn)物。這種棕色沉淀不溶于酒精和

32、其它有機(jī)溶劑,對(duì)于必需使用傳統(tǒng)復(fù)染和封固介質(zhì)的免疫組化染色應(yīng)用特別理想。 對(duì)于AP標(biāo)記的二抗我們選用BCIP and NBT 顯色,它們?cè)趬A性磷酸酶(AP)作用下反應(yīng)可生成一種不溶性黑紫色沉淀的強(qiáng)信號(hào)。 Western顯色 ECL靈敏度比DAB高不少 雜帶多的原因無(wú)非是幾點(diǎn): 1、你的一抗如是多克隆抗體,可以試著降低一抗的濃度,如一抗是單抗,可適當(dāng)降低二抗的濃度 2、還有最重要的是確保封閉的充分,封閉最好時(shí)間長(zhǎng)點(diǎn),至少2小時(shí)室溫封閉,時(shí)間允許可4度過(guò)夜封閉 3、就是洗膜一定要充分我們一般PBST 10分鐘三次,還有看你是DAB 顯色吧,背景過(guò)深,DAB顯色時(shí)間不要過(guò)長(zhǎng),一般2分鐘

33、足夠。 做一個(gè)好的陰性和陽(yáng)性對(duì)照。這樣出來(lái)的帶該在哪個(gè)位置,不該在哪個(gè)位置一目了然 十、分析結(jié)果及其判斷 常見(jiàn)問(wèn)題原因分析及處理方法: 見(jiàn)附錄一、二。 附錄一:Troubleshooting Blotting Problems (P43-48) 附錄二:Western Blotting Troubleshooting Logic Tree (P390-394) 附錄三:試驗(yàn)中所用到的試劑和緩沖溶液 1) 5x Stop Solution (Sample buffer) pH6.7: Stock: to use: 20% Glycerol 100ml take

34、9.5ml stock 10% SDS 50g 250mM Tris bromphenol blue or total 475.00ml pyronine 4 to taste 2) Gel solution (30% w/v acrylamide mix): 0.8 bis-acrylamide 29.2% acrylamide total 100ml 3) 2x Laemmli Separation Buffer: Tris-HCl 0.2% SDS 10ml 20% SDS total 1000ml 4) 2x Laemmli Stacking

35、 Buffer: Tris 0.2% SDS 1g total 500ml 5) 10x Laemmli Running Buffer: 250mM Tris Glycine 1% SDS 20g total 2 liters 6) Transfer Buffer: 48mM Tris base 39mM Glycine 0.037% SDS g 20% MeOH 200ml total 1000ml 7) TBST: 10mM Tris-HCl, 100mM NaCl 0.2% Tween-20 Total 1000ml

36、 8) Coomassie Stain : 40%MeOH 400ml 10%HAc 100ml 0.1%BBR 1g Brilliant Blue R total 1000ml 9) Destain: 30%MeOH 300ml 7.5%HAc 75ml total 1000ml 10) 10×麗春紅染液配方: 麗春紅 2g 磺基水楊酸 30g 三氯醋酸 30g total 100ml 11)DAB DAB 50mg 0.05mol/L TB (PH7.6) 100ml 30%H2O2 30-40ul 先配成2-5倍的儲(chǔ)存液,過(guò)濾后分裝,-20℃避光

37、保存,H2O2在工作液中終濃度0.01% 不顯影不一定是抗原性喪失,Western blot 環(huán)節(jié)多,一抗和二抗原因是wb中比較難掌握準(zhǔn)的環(huán)節(jié)。 western blot的個(gè)人總結(jié)zz 1. WESTERN BLOT電轉(zhuǎn)膜時(shí)間與分子量大小有關(guān),即大分子量的需要轉(zhuǎn)印時(shí)間長(zhǎng)些,才能轉(zhuǎn)到NC膜上去。小分子量的需要轉(zhuǎn)印時(shí)間短些。 我們用BIO-RAD電轉(zhuǎn)膜儀,30-80KD蛋白需要恒電流350毫安,70分鐘。15-30KD蛋白需要恒電流200毫安60分鐘。大于80KD蛋白需要恒電流350毫安120分鐘。同時(shí)電泳緩沖液要經(jīng)常更換。條件你要摸素,好運(yùn)?。?! 2. 每次做we

38、stern blot 都遇到這個(gè)現(xiàn)象 膠上的蛋白條帶 很好 但轉(zhuǎn)膜后總是出現(xiàn)這種情況,麗春紅染色后發(fā)現(xiàn)蛋白條帶總是出現(xiàn)流水樣飄走了.我用濕式轉(zhuǎn)移 bio-rad 冰水 100伏 100分鐘 nc 膜 應(yīng)該不是氣泡,轉(zhuǎn)膜液沒(méi)問(wèn)題 請(qǐng)高手分析 首先多謝各位高手相助,經(jīng)過(guò)反復(fù)摸索,原來(lái)并不是轉(zhuǎn)膜時(shí)間和電壓的問(wèn)題,也不是nc膜像各位說(shuō)的那樣比較差。原因真的是非常簡(jiǎn)單,只是因?yàn)槲覀兊霓D(zhuǎn)膜儀使用時(shí)間太長(zhǎng),兩塊板之間的海綿由于長(zhǎng)期使用變得很薄。當(dāng)按照陰極-海棉-濾紙-膠-膜-濾紙-海綿依次放好后兩塊板不能壓緊,因而在膠和膜之間可能存在潛在的間隙,電轉(zhuǎn)移時(shí)蛋白從膠和膜之間的空隙中流走,形成如圖所示的

39、形狀。我僅使用十幾張普通的草紙墊在兩塊海棉之間,條帶就變得非常的漂亮。這也是在大家的幫助下共同發(fā)現(xiàn)的。想到我求助時(shí)各位熱心的幫助,因此在原文下加上了本人最終解決問(wèn)題的方法,這是對(duì)大家的感激,也希望更多實(shí)驗(yàn)中遇到困惑的同事們能從中得到啟迪。一個(gè)小小的失誤的確是很讓人頭疼得哦,讓我們都變得細(xì)心起來(lái)。而且便宜的東西不一定不好,nc雖比不上pvdf轉(zhuǎn)染效率高,用的好一樣能達(dá)到試驗(yàn)?zāi)康摹_@對(duì)像我一樣的窮學(xué)生,比較有鼓勵(lì)性吧,呵呵。再次感謝各位 3. 看樣子是濕轉(zhuǎn),注意幾點(diǎn):1.換為PVDF膜 2.記住, 電轉(zhuǎn)液必須有甲醇.3. 用PVDF電轉(zhuǎn)前要在甲醇中泡3-5分鐘.NC膜則不能在純甲醇中泡

40、,否則會(huì)溶解.4.4度冷卻很重要.5 轉(zhuǎn)膜后一般膠上都會(huì)有剩,關(guān)鍵是膜上的蛋白是否理想,對(duì)初學(xué)者一定要用麗春紅染色,如不理想就不用往下做了.5. 注意濾紙一定要剪的和膠一樣大小,兩快濾紙不能接觸,否則會(huì)短路.6. 建議貴實(shí)驗(yàn)室用Biorad 的半干轉(zhuǎn)移系統(tǒng),都什么年代了,還用...呵呵 4. 一抗的稀釋比例是都不相同的,一般根據(jù)說(shuō)明書(shū)的推薦來(lái)做,有條件的可以做梯度稀釋?zhuān)鞒鲎约旱臈l件來(lái)。 一般稀釋范圍在1:100-1:5000, WB. 我做過(guò)的極限是1:500000 wb 就我的經(jīng)驗(yàn)看,就整個(gè)Western Blot來(lái)說(shuō), 我覺(jué)得最關(guān)鍵的步驟在前面,1.制樣 2.電泳 3

41、.轉(zhuǎn)移 4. Block,其中1和3更為重要, 后面的步驟按照標(biāo)準(zhǔn)來(lái)就行了, 最多有一些小調(diào)整。 你們?cè)趯?shí)際應(yīng)用中有問(wèn)題可問(wèn), 越具體越好。我盡量解答 請(qǐng)教一下,半干轉(zhuǎn)是否要求膜,3m濾紙,膠同樣大?。? 因?yàn)槟z大小不一定規(guī)則,膜和濾紙會(huì)大一點(diǎn),那樣會(huì)不會(huì)短路? 什么是短路?如何控制和發(fā)現(xiàn)短路呢?謝謝指點(diǎn) 答: 一般參照 膜>= 濾紙> 膠, 就行, 你轉(zhuǎn)移前和轉(zhuǎn)移過(guò)程中看看電壓就行,正常的半干是慢慢變高的, 最后結(jié)束時(shí)一般是開(kāi)始的1.5-3倍都是正常的。一般Buffer和濾紙選的對(duì)就不會(huì)短路. 想請(qǐng)教Western的結(jié)果如何分析,一定要有內(nèi)參照嗎? 答: 不一定,但是最好

42、能有Marker,我做的Western 都用了Marker 如果你做定量或辦定量,至少要用到一個(gè)光密度掃描分析軟件, 如果不是,直接分析就可以了 我的Western轉(zhuǎn)膜已經(jīng)成功了,但是Marker泳道未見(jiàn)蛋白條帶(正常應(yīng)該有6條) ,其余各泳道均有清晰的蛋白條帶,經(jīng)考馬斯亮藍(lán)染膠,結(jié)果相同。經(jīng)5%的脫脂牛奶封閉1小時(shí)45分鐘后,進(jìn)行一抗孵育(1:200,建議起始濃度)過(guò)夜,二抗孵育5個(gè)半小時(shí)(1:2000),均在室溫下,DAB顯色,雖出現(xiàn)蛋白條帶,但較弱,且出現(xiàn)非特異性條帶。請(qǐng)ptglab幫忙分析一下: 1、Marker是否有問(wèn)題?是MBI公司的,可分離14-11

43、6KD的蛋白,買(mǎi)了大概有一年的時(shí)間啦。 2、一抗(為多克隆抗體)、二抗的濃度及孵育的時(shí)間是否合適? 3、封閉的時(shí)間是否太短? 答: 恭喜呀! 1. marker 有可能被降解了, 也有可能是它標(biāo)稱(chēng)的上樣量太少, 不夠, 我做過(guò)一個(gè)標(biāo)稱(chēng)每次5ul可我上了20ul才行的。 2.建議,一抗4度過(guò)夜也很好, 建議1:100,室溫2hrs就夠了, 3. 2抗室溫1小時(shí),1:2000, 我喜歡4度封閉過(guò)夜(室溫2hr就夠了),1抗室溫1hr,2抗室溫1hr, 最好是一抗4度過(guò)夜(或室溫2小時(shí))1:200,2抗室溫1小時(shí)1:2000, 換Ecl法. tracyzang wrote:

44、 如果不是顯色的問(wèn)題,那我如何分析呢? 國(guó)外做的蛋白條帶很強(qiáng)。我買(mǎi)的是Santa Cruz的抗體,也實(shí)驗(yàn)過(guò)一抗和二抗肯定能結(jié)合,二抗加DAB肯定能顯色。電泳的膠用考馬斯亮藍(lán)染色沒(méi)問(wèn)題,但是不知道與Marker對(duì)應(yīng)的條帶是否是我要的(我目的蛋白的分子量分別是55KD、29KD)。半干法2小時(shí)轉(zhuǎn)膜后,麗春紅染色發(fā)現(xiàn)大分子量蛋白轉(zhuǎn)過(guò)去的較少。 難道是裂解液出了問(wèn)題?我用的是三去污劑,但沒(méi)加疊氮鈉和大概叫Apoptin的那種蛋白酶抑制劑。冰上裂解 -80度凍存的細(xì)胞,4度12000g離心5分鐘,取上清,與分子克?。ǖ诙妫┥系募訕觔uffer混合,沸水變性5分鐘,上樣。 我真的不知道是哪里出了

45、問(wèn)題,幫幫忙吧! 答: 我的建議: 1、首先確定您提的蛋白質(zhì)量如何?可用PIERCE公司的BCA試劑盒測(cè)蛋白的濃度,一般來(lái)講,其濃度應(yīng)該在幾-20微克/微升。 2、若是蛋白沒(méi)問(wèn)題,哪就看是不是電泳的問(wèn)題,首先要看膠的濃度,您目的蛋白的分子量分別是55KD、29KD,建議分別用10%和12%的膠。60-80V,1小時(shí)左右。跑過(guò)積層膠與分離膠的線時(shí),換用100V,3-4小時(shí)。 3、轉(zhuǎn)膜,建議恒壓,15V,不用轉(zhuǎn)2小時(shí),45分鐘足以。您所說(shuō)的大蛋白轉(zhuǎn)過(guò)去的,并不是真正的少,而是因?yàn)樵谔岬牡鞍字写蟮鞍妆旧砭秃苌佟N以?jīng)也轉(zhuǎn)過(guò)2小時(shí),但和45分鐘的區(qū)別并不大。 4、根據(jù)MARKER的條帶(我

46、的是7條帶:14、18、25、35、45、66、116KD),您根據(jù)MARKER的條帶剪下25與35之間(29KD)的條帶,45-66之間(50KD)的條帶。這樣第一,可以節(jié)省抗體,第二,您要的目的條帶肯定在上面。 5、延長(zhǎng)1抗、2抗孵育時(shí)間(我曾室溫1小時(shí),4度過(guò)夜),適當(dāng)加大1抗?jié)舛取? 6、我買(mǎi)的也是Santa Cruz的抗體,我覺(jué)得質(zhì)量還可以,我想您應(yīng)該先找其他方面的原因。 pVDF膜和NC膜都可以,一般質(zhì)量都行 6*8的膜我一般用到了2.5ml,膜可以用封口膜塑料袋封起來(lái),這樣比較節(jié)約抗體,如果抗體非常珍貴,可以使用后回收(-70保存), 如果你一張膜只加一種抗體,可以

47、在轉(zhuǎn)膜后用麗春紅染一下,根據(jù)mark的位置對(duì)應(yīng)找到需要的蛋白所在的位置,這樣在以后的轉(zhuǎn)膜中可以將膠剪小,這樣比較省膜。 在電泳時(shí),緩沖液最好和玻璃板上緣平齊,這樣條帶壓得要好一些的 to tracyzang: 1.電泳用的是恒流,一塊膠,20mA,100分鐘左右。 電泳的條件:樣品的分子量決定了膠的濃度,一般使樣品跑至膠的中部即可。正常條件下,電泳時(shí)溴酚藍(lán)和10kd左右蛋白跑在一起。由此可以決定電泳的電壓和時(shí)間。建議你用恒壓80-100伏。 2.轉(zhuǎn)膜也是恒流,38mA,100分鐘。而且我用別人的細(xì)胞和一抗在我的整個(gè)反應(yīng)體系下做出來(lái)了,當(dāng)然彼此的目的蛋白不同。所以,我想問(wèn)題

48、應(yīng)該出在抗原和一抗上,不知對(duì)不對(duì)。一抗我買(mǎi)的是單抗,推薦的稀釋度是1:100——1:1000。我用的是1:100。難道非要用多抗嗎?按道理單抗也應(yīng)該出條帶呀! 做wb時(shí)理論上單抗也應(yīng)該有帶,但由于單抗識(shí)別抗原結(jié)構(gòu)的單一性,有時(shí)候?qū)τ诳乖哪承┙Y(jié)構(gòu)不識(shí)別,因而wb的結(jié)果有時(shí)候不好。 3.細(xì)胞用三去污劑裂解的,沒(méi)有做定量,加巰基乙醇變性后,每孔上樣20微升。提出的蛋白我保存在4度了,這樣行嗎? 這個(gè)制樣步驟沒(méi)什么問(wèn)題。 請(qǐng)教1:是否WB實(shí)驗(yàn)半定量一定要加ACTIN內(nèi)參; 對(duì)于發(fā)表文章的實(shí)驗(yàn)最好加內(nèi)參,實(shí)驗(yàn)嚴(yán)謹(jǐn)。 2:發(fā)中華級(jí)文章要求結(jié)果用膠片還是膜照相相片,用掃描儀掃描

49、膜后沖印相片行不?; 國(guó)內(nèi)的文章要求不是很高,最好用的照片。當(dāng)然了這取決于你的照片的結(jié)果。 3:用BANDSCAN分析結(jié)果行嗎? 分析一般的結(jié)果沒(méi)問(wèn)題。 4:蛋白定量后加多少u(mài)g總蛋白(全細(xì)胞總蛋白)合適? 總蛋白量有個(gè)上限的, (具體的我忘了, )但是最好不要超過(guò)150ug/well 我回公司后給你個(gè)具體的答復(fù)。 轉(zhuǎn)膜后的脫脂奶粉封閉液是5%的TBST脫脂奶粉。 tris-h(huán)cl就是tris鹽用hcl調(diào)ph值,配置而成。 to:iamsunkai 對(duì)于第一個(gè)問(wèn)題:影響跑膠跑的質(zhì)量,有以下幾個(gè)因素: 1. 電壓,小的電壓會(huì)使膠的分子篩效應(yīng)得到充

50、分發(fā)揮。電壓越小,條帶越漂亮,濃縮膠80v,分離膠100v就能跑得很好。 2. 膠的均勻度,膠越均勻,條帶越窄,分離越均勻。倒膠之前,一定要充分混勻,玻璃板一定要干凈,雙蒸水隔離時(shí),一定要比較輕地加上去,避免稀釋上層的分離膠,使膠不均勻。 第二,可以用, 2.0-3.0mA/cm2, 2hrs 第三,小分子的蛋白在轉(zhuǎn)移過(guò)程中,會(huì)透過(guò)膜去,所以大分子的上去以后,有一部分小分子的就透過(guò)去了。 對(duì)于第四個(gè)問(wèn)題,我想你是不是要問(wèn):“我要檢測(cè)的抗原(蛋白)是160kd的,但是結(jié)果只有50kd的那條帶,同時(shí),背景又相對(duì)來(lái)說(shuō)比較干凈,條帶比較清楚,想請(qǐng)你給我提點(diǎn)建議”,是嗎? 首先分析你的

51、整個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟。我發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)比較大的毛病: 1. 一抗用TBST稀釋。按照我的理解,一抗最好用5%的TBST脫脂牛奶稀釋?zhuān)湍愕姆忾]液相一致,這樣可以降低背景。你大概也意識(shí)到了,? 2. “biorad半干轉(zhuǎn)PDVF膜,15v轉(zhuǎn)30分鐘”,你是這么做的嗎?因?yàn)槲掖蟛糠謺r(shí)間是做的恒流轉(zhuǎn)移,用的是0.1mA/膜,100kd--200kd轉(zhuǎn)2小時(shí)。到最后電壓會(huì)升到20v左右。你用恒壓法,我不是很肯定你轉(zhuǎn)30分鐘能將大分子(160kd)的抗原轉(zhuǎn)上去。我建議你最好能將時(shí)間延長(zhǎng),如果是恒流,可按我的做法;如果是恒壓,可摸索一下,適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間。有時(shí)候你的marker也有可能欺騙你,因?yàn)閙arker的量比較

52、大,是很容易轉(zhuǎn)上去的,實(shí)際上目標(biāo)蛋白的量遠(yuǎn)遠(yuǎn)少于marker量。 我對(duì)你的結(jié)果分析如下: 1. 你的結(jié)果很好,估計(jì)離目標(biāo)不遠(yuǎn)了,很快就可以成功。 2. 沒(méi)有160kd的帶是因?yàn)槟愕霓D(zhuǎn)移時(shí)間過(guò)短,適當(dāng)延長(zhǎng)轉(zhuǎn)移時(shí)間(我懷疑這是主要的問(wèn)題)。 3. 你的一抗用1:10,2抗可以降到1:5000, 背景會(huì)低一點(diǎn)。 shybird6011 wrote: ptglab:您好! 最近我在做Western,但結(jié)果一直不理想,出來(lái)的只是淺淺的帶,甚至現(xiàn)在什么條帶也沒(méi)有了!我每次轉(zhuǎn)膜后都用了立春紅染色,出現(xiàn)的蛋白條帶還是很清晰,唯一的一點(diǎn)是在我需要的分子量附近并沒(méi)有很清晰的條帶出現(xiàn),只是很

53、模糊的多條帶,是不是從這里就可以推斷出我的結(jié)果就會(huì)不理想!郁悶中,請(qǐng)您指教!?。。?!謝謝您 答: 不是的,因該沒(méi)有問(wèn)題,要知道大部分目的蛋白含量少因該是看不到的,只要你目的蛋白前后的蛋白轉(zhuǎn)移地都很好就可以了。 緊急求助?。?!我最近做了一次WB,結(jié)果很奇怪,背景是中棕色的,而轉(zhuǎn)上的蛋白帶是白色的,與正常顯色恰恰相反,我簡(jiǎn)直是哭笑不得。我買(mǎi)的一抗是單抗,ELISA要求1:4000-1:10000,我用的是1:4000,二抗ELISA要求1:4000-1:8000,我用的1:4000。第一次做時(shí)有目的帶,但是由于有雜帶,懷疑抗體加多了就將了一下濃度,結(jié)果出現(xiàn)了這么怪的問(wèn)題。請(qǐng)pt

54、glab 高手及其他同志幫幫在下。 答: WB所需抗體濃度應(yīng)按說(shuō)明書(shū),一般為1:1000左右,有些適于做ELISA的抗體不一定適于做WB,一抗與二抗需配套使用,背景高可能是封閉不夠。 rainycloud wrote: 我目前研三在讀,但課題才剛剛完成模型和整體實(shí)驗(yàn)部分,接下來(lái)老板又要求采用Western-blot的方法對(duì)我所檢測(cè)的蛋白進(jìn)行半定量,真是一頭霧水,還請(qǐng)前輩千萬(wàn)多幫幫我,本人將不勝感激! 1.我所測(cè)定的蛋白分子量是105KD,按理說(shuō)分離膠應(yīng)當(dāng)采用7.5%,但我所查資料卻要求分離膠和濃縮膠均采用11%的配方,不知為何? 2.但我還是照著做了,結(jié)果是有的,但非常

55、不穩(wěn)定。有時(shí)條帶清晰,有時(shí)很散,不知為何? 3.我原先采用的顯色方法是Ecl,但洗出來(lái)的片子有時(shí)很清晰,有時(shí)又非常糊,或者亂七八糟,不知這和轉(zhuǎn)膜時(shí)濾紙的厚度是否有關(guān),或者是因?yàn)槲业臑V紙反復(fù)使用,影響了轉(zhuǎn)膜效果?至于洗膜我是非常注意的,一般采用10分鐘一次,洗三次,TBS。 4.接下來(lái)我準(zhǔn)備采用DAB顯色技術(shù),二抗是生物素化的多克隆抗體,三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作調(diào)整,不能再用5%的脫脂奶粉呢?好像有資料說(shuō)脫脂奶粉會(huì)影響親和素生物素的生成,是嗎?不知前輩是否有比較成熟的方案以供參考? 答: 1,上述您提到的兩種凝膠均可以使用,因?yàn)椋保埃担耍牡牡鞍自谏鲜鰞煞N

56、膠的線性分辨范圍內(nèi),但需注意條帶位置. 2,可能:原因:樣品可能存在降解;轉(zhuǎn)膜不及時(shí)造成擴(kuò)散;轉(zhuǎn)移緩沖液甲醇濃度(NC膜可加到20%,PVDF加到15%) 3,您指的模糊是說(shuō)背景高還是條帶模糊? 4,不能使用脫脂奶粉,因?yàn)槊撝谭壑泻锼兀茫拢樱链鎽?yīng)該好一點(diǎn). ptglab真不錯(cuò),又有事求你老人家了。最近又試了兩次WESTERN ,結(jié)果在轉(zhuǎn)膜這步就卡住了。 我們用的濕式電轉(zhuǎn)移,一次是50V、12小時(shí)(轉(zhuǎn)移緩沖液中無(wú)甲醇);麗春紅染色無(wú) 另一次120V、2小時(shí)(加了甲醇)。麗春紅染色MARKER有一條帶 兩次麗春紅染色幾乎沒(méi)有蛋白條帶(蛋白質(zhì)上樣應(yīng)沒(méi)問(wèn)題,膠用卡馬斯亮

57、藍(lán)染色有),轉(zhuǎn)移后的凝膠用卡馬斯亮藍(lán)染色也無(wú)條帶。蛋白質(zhì)跑哪里去了? 難道轉(zhuǎn)過(guò)頭了嗎? 我曾經(jīng)用第一種條件轉(zhuǎn)出來(lái)過(guò),難道緩沖液有問(wèn)題? 我的問(wèn)題是:1,是否必須有麗春紅染出較為明顯條帶才能進(jìn)行下一步? 2,我的分子量是30KD,用濕式電轉(zhuǎn)移槽(北京六一)轉(zhuǎn)移條件以那種方式最好? 先謝謝各位的帖子,摸索條件太費(fèi)勁,如能借各位經(jīng)驗(yàn)少走彎路就好了。 答: to caimingc, 你可以用在第一種緩沖液里加20%甲醇,然后36V 5-15hrs。30KD就可以上去了。 另外,你用的PVDF膜用甲醇活化的吧?你的電極方向沒(méi)有反吧 western blot的個(gè)人總結(jié)zz 1.

58、 WESTERN BLOT電轉(zhuǎn)膜時(shí)間與分子量大小有關(guān),即大分子量的需要轉(zhuǎn)印時(shí)間長(zhǎng)些,才能轉(zhuǎn)到NC膜上去。小分子量的需要轉(zhuǎn)印時(shí)間短些。 我們用BIO-RAD電轉(zhuǎn)膜儀,30-80KD蛋白需要恒電流350毫安,70分鐘。15-30KD蛋白需要恒電流200毫安60分鐘。大于80KD蛋白需要恒電流350毫安120分鐘。同時(shí)電泳緩沖液要經(jīng)常更換。條件你要摸素,好運(yùn)?。。? 2. 每次做western blot 都遇到這個(gè)現(xiàn)象 膠上的蛋白條帶 很好 但轉(zhuǎn)膜后總是出現(xiàn)這種情況,麗春紅染色后發(fā)現(xiàn)蛋白條帶總是出現(xiàn)流水樣飄走了.我用濕式轉(zhuǎn)移 bio-rad 冰水 100伏 100分鐘 nc 膜 應(yīng)該不是

59、氣泡,轉(zhuǎn)膜液沒(méi)問(wèn)題 請(qǐng)高手分析 首先多謝各位高手相助,經(jīng)過(guò)反復(fù)摸索,原來(lái)并不是轉(zhuǎn)膜時(shí)間和電壓的問(wèn)題,也不是nc膜像各位說(shuō)的那樣比較差。原因真的是非常簡(jiǎn)單,只是因?yàn)槲覀兊霓D(zhuǎn)膜儀使用時(shí)間太長(zhǎng),兩塊板之間的海綿由于長(zhǎng)期使用變得很薄。當(dāng)按照陰極-海棉-濾紙-膠-膜-濾紙-海綿依次放好后兩塊板不能壓緊,因而在膠和膜之間可能存在潛在的間隙,電轉(zhuǎn)移時(shí)蛋白從膠和膜之間的空隙中流走,形成如圖所示的形狀。我僅使用十幾張普通的草紙墊在兩塊海棉之間,條帶就變得非常的漂亮。這也是在大家的幫助下共同發(fā)現(xiàn)的。想到我求助時(shí)各位熱心的幫助,因此在原文下加上了本人最終解決問(wèn)題的方法,這是對(duì)大家的感激,也希望更多實(shí)驗(yàn)中遇

60、到困惑的同事們能從中得到啟迪。一個(gè)小小的失誤的確是很讓人頭疼得哦,讓我們都變得細(xì)心起來(lái)。而且便宜的東西不一定不好,nc雖比不上pvdf轉(zhuǎn)染效率高,用的好一樣能達(dá)到試驗(yàn)?zāi)康?。這對(duì)像我一樣的窮學(xué)生,比較有鼓勵(lì)性吧,呵呵。再次感謝各位 3. 看樣子是濕轉(zhuǎn),注意幾點(diǎn):1.換為PVDF膜 2.記住, 電轉(zhuǎn)液必須有甲醇.3. 用PVDF電轉(zhuǎn)前要在甲醇中泡3-5分鐘.NC膜則不能在純甲醇中泡,否則會(huì)溶解.4.4度冷卻很重要.5 轉(zhuǎn)膜后一般膠上都會(huì)有剩,關(guān)鍵是膜上的蛋白是否理想,對(duì)初學(xué)者一定要用麗春紅染色,如不理想就不用往下做了.5. 注意濾紙一定要剪的和膠一樣大小,兩快濾紙不能接觸,否則會(huì)短路.

61、6. 建議貴實(shí)驗(yàn)室用Biorad 的半干轉(zhuǎn)移系統(tǒng),都什么年代了,還用...呵呵 4. 一抗的稀釋比例是都不相同的,一般根據(jù)說(shuō)明書(shū)的推薦來(lái)做,有條件的可以做梯度稀釋?zhuān)鞒鲎约旱臈l件來(lái)。 一般稀釋范圍在1:100-1:5000, WB. 我做過(guò)的極限是1:500000 wb 就我的經(jīng)驗(yàn)看,就整個(gè)Western Blot來(lái)說(shuō), 我覺(jué)得最關(guān)鍵的步驟在前面,1.制樣 2.電泳 3.轉(zhuǎn)移 4. Block,其中1和3更為重要, 后面的步驟按照標(biāo)準(zhǔn)來(lái)就行了, 最多有一些小調(diào)整。 你們?cè)趯?shí)際應(yīng)用中有問(wèn)題可問(wèn), 越具體越好。我盡量解答 請(qǐng)教一下,半干轉(zhuǎn)是否要求膜,3m濾紙,膠同樣大小?

62、 因?yàn)槟z大小不一定規(guī)則,膜和濾紙會(huì)大一點(diǎn),那樣會(huì)不會(huì)短路? 什么是短路?如何控制和發(fā)現(xiàn)短路呢?謝謝指點(diǎn) 答: 一般參照 膜>= 濾紙> 膠, 就行, 你轉(zhuǎn)移前和轉(zhuǎn)移過(guò)程中看看電壓就行,正常的半干是慢慢變高的, 最后結(jié)束時(shí)一般是開(kāi)始的1.5-3倍都是正常的。一般Buffer和濾紙選的對(duì)就不會(huì)短路. 想請(qǐng)教Western的結(jié)果如何分析,一定要有內(nèi)參照嗎? 答: 不一定,但是最好能有Marker,我做的Western 都用了Marker 如果你做定量或辦定量,至少要用到一個(gè)光密度掃描分析軟件, 如果不是,直接分析就可以了 我的Western轉(zhuǎn)膜已經(jīng)成功了,但

63、是Marker泳道未見(jiàn)蛋白條帶(正常應(yīng)該有6條) ,其余各泳道均有清晰的蛋白條帶,經(jīng)考馬斯亮藍(lán)染膠,結(jié)果相同。經(jīng)5%的脫脂牛奶封閉1小時(shí)45分鐘后,進(jìn)行一抗孵育(1:200,建議起始濃度)過(guò)夜,二抗孵育5個(gè)半小時(shí)(1:2000),均在室溫下,DAB顯色,雖出現(xiàn)蛋白條帶,但較弱,且出現(xiàn)非特異性條帶。請(qǐng)ptglab幫忙分析一下: 1、Marker是否有問(wèn)題?是MBI公司的,可分離14-116KD的蛋白,買(mǎi)了大概有一年的時(shí)間啦。 2、一抗(為多克隆抗體)、二抗的濃度及孵育的時(shí)間是否合適? 3、封閉的時(shí)間是否太短? 答: 恭喜呀! 1. marker 有可能被降解了, 也有可能是它標(biāo)稱(chēng)的上

64、樣量太少, 不夠, 我做過(guò)一個(gè)標(biāo)稱(chēng)每次5ul可我上了20ul才行的。 2.建議,一抗4度過(guò)夜也很好, 建議1:100,室溫2hrs就夠了, 3. 2抗室溫1小時(shí),1:2000, 我喜歡4度封閉過(guò)夜(室溫2hr就夠了),1抗室溫1hr,2抗室溫1hr, 最好是一抗4度過(guò)夜(或室溫2小時(shí))1:200,2抗室溫1小時(shí)1:2000, 換Ecl法. tracyzang wrote: 如果不是顯色的問(wèn)題,那我如何分析呢? 國(guó)外做的蛋白條帶很強(qiáng)。我買(mǎi)的是Santa Cruz的抗體,也實(shí)驗(yàn)過(guò)一抗和二抗肯定能結(jié)合,二抗加DAB肯定能顯色。電泳的膠用考馬斯亮藍(lán)染色沒(méi)問(wèn)題,但是不知道與Mark

65、er對(duì)應(yīng)的條帶是否是我要的(我目的蛋白的分子量分別是55KD、29KD)。半干法2小時(shí)轉(zhuǎn)膜后,麗春紅染色發(fā)現(xiàn)大分子量蛋白轉(zhuǎn)過(guò)去的較少。 難道是裂解液出了問(wèn)題?我用的是三去污劑,但沒(méi)加疊氮鈉和大概叫Apoptin的那種蛋白酶抑制劑。冰上裂解 -80度凍存的細(xì)胞,4度12000g離心5分鐘,取上清,與分子克隆(第二版)上的加樣buffer混合,沸水變性5分鐘,上樣。 我真的不知道是哪里出了問(wèn)題,幫幫忙吧! 答: 我的建議: 1、首先確定您提的蛋白質(zhì)量如何?可用PIERCE公司的BCA試劑盒測(cè)蛋白的濃度,一般來(lái)講,其濃度應(yīng)該在幾-20微克/微升。 2、若是蛋白沒(méi)問(wèn)題,哪就看是不是電泳的問(wèn)

66、題,首先要看膠的濃度,您目的蛋白的分子量分別是55KD、29KD,建議分別用10%和12%的膠。60-80V,1小時(shí)左右。跑過(guò)積層膠與分離膠的線時(shí),換用100V,3-4小時(shí)。 3、轉(zhuǎn)膜,建議恒壓,15V,不用轉(zhuǎn)2小時(shí),45分鐘足以。您所說(shuō)的大蛋白轉(zhuǎn)過(guò)去的,并不是真正的少,而是因?yàn)樵谔岬牡鞍字写蟮鞍妆旧砭秃苌佟N以?jīng)也轉(zhuǎn)過(guò)2小時(shí),但和45分鐘的區(qū)別并不大。 4、根據(jù)MARKER的條帶(我的是7條帶:14、18、25、35、45、66、116KD),您根據(jù)MARKER的條帶剪下25與35之間(29KD)的條帶,45-66之間(50KD)的條帶。這樣第一,可以節(jié)省抗體,第二,您要的目的條帶肯定在上面。 5、延長(zhǎng)1抗、2抗孵育時(shí)間(我曾室溫1小時(shí),4度過(guò)夜),適當(dāng)加大1抗?jié)舛取? 6、我買(mǎi)的也是Santa Cruz的抗體,我覺(jué)得質(zhì)量還可以,我想您應(yīng)該先找其他方面的原因。 pVDF膜和NC膜都可以,一般質(zhì)量都行 6*8的膜我一般用到了2.5ml,膜可以用封口膜塑料袋封起來(lái),這樣比較節(jié)約抗體,如果抗體非常珍貴,可以使用后回收(-70保存), 如果你一張膜只加一種抗體,可以在轉(zhuǎn)膜后

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