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病毒學(xué)第五章病毒的遺傳與變異

上傳人:ren****ao 文檔編號(hào):249079332 上傳時(shí)間:2024-10-27 格式:PPT 頁(yè)數(shù):29 大?。?44.82KB
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1、單擊此處編輯母版標(biāo)題樣式,單擊此處編輯母版文本樣式,第二級(jí),第三級(jí),第四級(jí),第五級(jí),*,第五章 病毒的遺傳與變異,第一節(jié) 病毒的突變,第二節(jié) 病毒的重組,第三節(jié) 影響病毒表型的病毒間相互作用,本章重點(diǎn),1.,病毒突變的類型,2.,病毒重組的機(jī)制,3.,病毒的復(fù)活,4.,病毒的干擾,第一節(jié) 病毒的突變,一、突變的定義,病毒遺傳物質(zhì)核酸的組成或結(jié)構(gòu)發(fā)生改變稱為突變(,mutation)。,株(,strain)、,型(,type)、,變異株(,variant)、,突變體(,mutant)、,野生型(,wild-type)、,野外分離株(,field isolates),通常用“株”來(lái)區(qū)分同一病毒的不

2、同野生型,“型”是感染性中和作用確定的血清型的同義語(yǔ)。,在沒(méi)有任何已知誘變劑存在的條件下,一些病毒在子代中產(chǎn)生高比例的突變體。,DNA,病毒中自發(fā)突變率為10,-8,-10,-11,,,RNA,病毒中為10,-3,-10,-4,。,RNA,復(fù)制酶缺少校正閱讀活性。,二、自發(fā)突變(,spontaneous mutation),RNA,病毒由于其復(fù)制的保真度較低,因此,人們提出了準(zhǔn)種(,quasispecies,)的概念。所謂準(zhǔn)種,即是一組自身復(fù)制的分子,它們彼此不同,但又密切相關(guān)。,準(zhǔn)種的演變是從一個(gè)原始的特定病毒序開始的,該病毒的每一輪復(fù)制均導(dǎo)致變異株的出現(xiàn)。因此,在任何時(shí)點(diǎn),某病毒群(,vi

3、ral population,)總是由常見的代表性序列即主序列(,master sequence,)和一組不同的但又密切相關(guān)的序列(變異株)所組成。,所有這些相關(guān)的序列(變異株),不管其所占比例如何,均被認(rèn)為是一群復(fù)制體(,replicon,),表現(xiàn)為動(dòng)態(tài)的基因相互作用(,dynamic genetic interaction,)。,當(dāng)環(huán)境發(fā)生改變時(shí),在原病毒群中已存在的各種變異株,以及在復(fù)制過(guò)程中新生代的變異株中,將被選擇出最適應(yīng)于新環(huán)境的變異株。爾后,被選擇出的變異株又面臨新環(huán)境的變化。為了其子代能繼續(xù)復(fù)制,將再次被選擇出適應(yīng)新環(huán)境的變異株。如此周而復(fù)始,不斷形成新的病毒群(即準(zhǔn)種)。,利

4、用自然界各種物理或化學(xué)誘變劑處理野生型病毒,提高病毒群體的突變率,稱為誘發(fā)突變。,體外誘變劑,對(duì)病毒靜態(tài)核苷酸進(jìn)行化學(xué)修飾,使其在后面的復(fù)制中發(fā)生錯(cuò)配,包括亞硝酸、羥胺、烷化劑等。,體內(nèi)誘變劑,它們的作用需要代謝活躍的核苷酸,一組為堿基類似物,另一組為插入劑。,UV,偶爾也用于病毒的誘變。,三、誘發(fā)突變,(,induced mutation),從突變引起的遺傳信息的意義改變來(lái)看,可分為,同義突變、錯(cuò)義突變和無(wú)義突變,。,有不少錯(cuò)義突變的產(chǎn)物仍然有部分活性,使表型介于突變型和野生型之間,為滲漏突變型。,有些錯(cuò)義突變不影響或基本不影響蛋白質(zhì)活性,不表現(xiàn)明顯的性狀變化,為中性突變,中性突變和同義突變

5、又常稱為沉默突變(,silent mutation)。,四、病毒突變類型,從突變帶來(lái)的表型改變來(lái)看,可分為噬菌斑形態(tài)突變體、致死突變體、條件致死突變體和生化突變體。,噬菌斑,形態(tài)突變體是指造成宿主細(xì)胞噬菌斑形態(tài)改變的突變體。,條件致死突變體是在某一條件下具有致死效應(yīng)而在另一條件下沒(méi)有致死效應(yīng)的突變體,如溫度敏感突變體,,28,35,可增殖,,37,40,不能增殖,具有減低毒力而保持免疫原性的特點(diǎn)。,生化突變體最常見的有營(yíng)養(yǎng)缺陷型突變體和抗藥性突變體,。,宿主范圍突變株:病毒基因組改變影響了對(duì)宿主細(xì)胞的感染范圍,可感染野生型病毒不能感染的細(xì)胞。,抗原性變異,病毒毒力變異。,五、回復(fù)突變,回復(fù)突變

6、,(reverse mutation):,突變體,(mutant),經(jīng)過(guò)第二次突變又完全地或部份地恢復(fù)為原來(lái)的基困型或表型。完全恢復(fù)是由于突變的堿基順序經(jīng)第二次突變后又變?yōu)樵瓉?lái)的堿基順序,故亦稱真正的回復(fù)突變。,部分恢復(fù)是由于第二次突變發(fā)生在另一部位上,其結(jié)果是部分恢復(fù)原來(lái)的表型,亦稱為第二位點(diǎn)突變,(second site mutation),或基因內(nèi)校正,(intragenic suppression),。此時(shí)原來(lái)的突變位點(diǎn)依然存在,而它的表型效應(yīng)被基因組上第二位點(diǎn)的突變所抑制,因而第二次突變又稱抑制突變(,suppressor mutation,),第二節(jié) 病毒的重組,改變的類型,改變內(nèi)

7、容,突變類型,多肽序列改變,多肽功能影響,取代,單核苷酸代換,同義突變,無(wú)(密碼簡(jiǎn)并),無(wú),錯(cuò)義突變,氨基酸代換,因氨基酸及序位而定,無(wú)義突變,延伸提前終止,一般失去,增加,缺失,單、寡核苷酸插入或缺失,移框突變,突變點(diǎn)后序列改變,一般失去,重組,基因組片段連接次序改變,病毒突變的分子機(jī)制,一、病毒重組的機(jī)制,病毒變異,除了自發(fā)和誘發(fā)突變外,還可能因病毒混合感染引起病毒之間的遺傳重組而發(fā)生。當(dāng)兩種或多種病毒感染同一宿主細(xì)胞,混合感染時(shí),有時(shí)發(fā)生兩株病毒基因組之間基因的交換、重配等遺傳結(jié)構(gòu)較大的變化,這就是病毒的基因重組。,根據(jù)病毒核酸是連續(xù)還是分節(jié)段,依次將病毒的基因重組分為分子內(nèi)重組(,in

8、tramolecular recombination,)和基因重配(,genetic reassorment,)。,分子內(nèi)重組還可以分為斷裂連接模式(,strand breakage and religation,)和拷貝選擇模式(,copy-choice,),斷裂連接模式:通常發(fā)生在單一分子基因組的,DNA,或,RNA,病毒中,重組需要核酸分子的斷裂及與其他核酸分子的再連接,即需要病毒的交配。,拷貝選擇重組(,copy-choice recombination):,發(fā)生在部分具單一分子基因組,RNA,病毒中(脊髓灰質(zhì)炎病毒、口疹病毒、冠狀病毒、口蹄疫病毒等),仍屬于分子內(nèi)重組,不涉及核酸分子

9、共價(jià)鍵的斷裂,,RNA,聚合酶選擇性連接的模板鏈上合成子代鏈,子代鏈?zhǔn)遣煌0彐湹钠唇印?基因重配:發(fā)生在具分段基因組的,RNA,病毒中(流感病毒、呼腸孤病毒、布尼安病毒和沙粒病毒等),重組時(shí),各片段在子代中隨機(jī)分布。,重組機(jī)制,親代,1,親代,2,子代,示例,分子內(nèi),重組,AbC ABc,ABC Abc,DNA,病毒和少數(shù),RNA,病毒(小,RNA,病毒)的突變體之間,ABC AST,ABT ASC,DNA,病毒不同毒株之間,ABCD XYZ,ABCZ,腺病毒失去基因,D,,獲得,SV40,基因,Z,ABC 123,12ABC3,溫和噬菌體、腫瘤病毒基因組整合進(jìn)細(xì)胞的基因組,基因重配,A/b

10、/C A/B/c,A/B/C,基因組分節(jié)段的,RNA,病毒,A/B/C A/S/T,A/S/C A/B/T,說(shuō)明:,A,等字母代表有活性的病毒基因;,1,,,2,,,3,表示有活性的細(xì)胞基因;,b,c,為突變體基因;,ABC,等字母代表連續(xù)線狀基因組;,A/B/C,表示分節(jié)段基因組,兩種病毒混合感染引起病毒基因組重組的幾種方式,二、基因重組的遺傳學(xué)效應(yīng),1,、復(fù)活現(xiàn)象,復(fù)合感染(,multiple infection):,一個(gè)細(xì)胞被多個(gè)病毒同時(shí)感染。,復(fù)活(,reactivation):,復(fù)合感染時(shí),滅活的病毒之間發(fā)生重組或滅活的病毒與有活力的病毒間發(fā)生重組,從而產(chǎn)生有感染活性重組子代病毒。,

11、復(fù)活現(xiàn)象,親代,1,親代,2,子代,說(shuō)明,交叉復(fù)活,紫外滅活者與異品系的相關(guān)病毒之間,abC,a/b/C,AST,A/S/T,ASC,A/S/C,用基因重排或分子內(nèi)重組拯救親代滅活基因,C,多重復(fù)活,不同基因失活的同種病毒的不同毒粒之間,ABc,A/B/c,AbC,A/b/C,ABC,A/B/C,基因,B,C,的重組或重配產(chǎn)生有活性的子代病毒,病毒復(fù)活現(xiàn)象,說(shuō)明:,A,B,C,代表有活性的病毒基因;,a,b,c,表示失活的病毒基因;,ABC,等字母代表連續(xù)線狀基因組;,A/B/C,表示分節(jié)段基因組,一株活性病毒與另一株相關(guān)但具有不同遺傳標(biāo)記的滅活病毒復(fù)合感染細(xì)胞,產(chǎn)生具有滅活病毒某些遺傳標(biāo)記的

12、活性病毒重組體,這類病毒復(fù)活現(xiàn)象稱為交叉復(fù)活,又稱標(biāo)記拯救(,marker rescue)。,首先在,T4,噬菌體中發(fā)現(xiàn)。,應(yīng)用:可以選擇性地獲得病毒重組體。,(1)交叉復(fù)活(,cross reactivation),活病毒與滅活病毒之間(交叉復(fù)活),A,3,株(流行株),新,A,3,抗原,雞胚中增殖不良,A,1,株(非流行株),舊,A,1,抗原,雞胚中生長(zhǎng)良好,雞胚中共同培養(yǎng),重組體(理想疫苗),有,A,3,抗原,雞胚中生長(zhǎng)良好,UV,滅活,當(dāng)基因型相同的多個(gè)滅活病毒顆粒感染同一細(xì)胞時(shí),由于滅活病毒之間發(fā)生重組,產(chǎn)生有感染性的重組體子代病毒。如流感病毒、呼腸孤病毒、狂犬病毒、脊髓灰質(zhì)炎病毒和

13、痘病毒。這是因?yàn)閮煞N病毒核酸上受損害的基因部位不同,由于重組合相互彌補(bǔ)而得到復(fù)活。因此現(xiàn)今不用紫外線滅活病毒制造疫苗,以防病毒復(fù)活的危險(xiǎn)。,(2),多重復(fù)活,(,mutliplicity reactivation),第三節(jié) 影響病毒表型的病毒間相互作用,一、表型混雜(,phenotypic mixing),病毒混合感染產(chǎn)生一種具有兩個(gè)親代病毒結(jié)構(gòu)蛋白(殼體或囊膜)的子代。其一種極端現(xiàn)象為轉(zhuǎn)殼現(xiàn)象。病毒的表型混雜為一種暫時(shí)現(xiàn)象,隨傳代而消失。,無(wú)囊膜病毒中,親緣關(guān)系密切的病毒間經(jīng)常發(fā)生表型混雜,常出現(xiàn)轉(zhuǎn)殼現(xiàn)象。,有囊膜病毒的表型混雜常表現(xiàn)為一個(gè)病毒的核衣殼包埋在另一個(gè)病毒的囊膜中,形成偽型病毒。

14、也有囊膜蛋白的嵌合混雜。,二、互補(bǔ)作用(,complementation,):,即病毒感染過(guò)程中基因產(chǎn)物間的相互作用,其結(jié)果是一種或兩種親本病毒產(chǎn)量增加,而兩種病毒在基因水平上并未改變。在這種情況下,一種病毒為另一個(gè)存在某種功能缺陷的病毒提供了該種功能基因產(chǎn)物。,三、病毒間的干擾,(,1,)干擾的定義:,在兩種病毒共同感染同一種細(xì)胞時(shí),可發(fā)生一種病毒抑制另一種病毒復(fù)制的現(xiàn)象。,干擾現(xiàn)象可在同種以及同株的病毒間發(fā)生,后者如流感病毒的自身干擾。異種病毒和無(wú)親緣關(guān)系的病毒之間也可以干擾,且比較常見。,(,2,)干擾的類型,a.,自身干擾:在復(fù)制過(guò)程中產(chǎn)生了缺陷性干擾顆粒(,defective int

15、erfering particle,DIP,),能干擾同種的正常病毒在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制,如流感病毒在雞胚尿囊液中連續(xù)傳代,則,DIP,逐漸增加而發(fā)生自身干擾。,b.,同種干擾:同種異型(流感病毒,A,、,B,),同型異株(流感病毒,A,1,、,A,2,),c.,異種干擾:第一種病毒占據(jù)或破壞了宿主細(xì)胞的表面受體或者改變了宿主細(xì)胞的代謝途徑因而阻止另一種病毒的吸附或穿入,如粘病毒等;另外,也可能是阻止第二種,mRNA,的轉(zhuǎn)譯,如脊髓灰質(zhì)炎病毒干擾水泡性口炎病毒。,(,3,)干擾的機(jī)理,a.,產(chǎn)生干擾素:最主要的干擾方式,b.,干擾病毒的吸附:阻斷病毒受體,c.,改變宿主細(xì)胞的代謝途徑:爭(zhēng)奪宿主細(xì)胞的酶及生物合成原料,干擾病毒的復(fù)制,d.,缺損病毒引起的干擾:缺陷干擾(,DI),病毒具有三個(gè)特征:缺陷性、干擾性和富集性。,(,4,)干擾的意義,a.,阻止或中斷病毒感染,自愈,b.,有病毒感染時(shí)暫不能預(yù)防接種減毒活疫苗,習(xí)題,1.,病毒基因組的變異有哪些類型?發(fā)生的幾率及后果如何?,2.,舉例說(shuō)明病毒表型變異的特點(diǎn)及應(yīng)用價(jià)值,3.,什么是缺陷型干擾突變?有何意義?,4.,試述“準(zhǔn)種”的概念,5.,定點(diǎn)誘變?nèi)绾芜M(jìn)行?,6.,分子內(nèi)重組與重配的結(jié)果與意義?,7.,什么是表型混合?,

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