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高性能計(jì)算導(dǎo)論并行計(jì)算性能評價(jià)ppt課件

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1、Click to edit Master title style,Click to Edit Master Text Styles Asd Gasd Glak Fdas Af Lkajds Laksdjf Hasldkf Asdkj H,Second Level Asdf Ias;df Has;dlf As;df Asd Fasdf Asdf Asd Af Sdfs Fdsasdf Sa,Third Level,Fourth Level,Fifth Level,我嚇了一跳,蝎子是多么丑惡和恐怖的東西,為什么把它放在這樣一個美麗的世界里呢?但是我也感到愉快,證實(shí)我的猜測沒有錯:表里邊有一個活的生

2、物,并行計(jì)算性能評價(jià),并行計(jì)算性能評價(jià),上海大學(xué)計(jì)算機(jī)工程與科學(xué)學(xué)院,計(jì)算的本質(zhì),串行計(jì)算模型圖靈機(jī),并行計(jì)算模型,計(jì)算效能評價(jià),計(jì)算模型與效能評價(jià),高性能計(jì)算導(dǎo)論,上海大學(xué)計(jì)算機(jī)工程與科學(xué)學(xué)院 計(jì)算的本質(zhì)計(jì)算模型與效能評價(jià)高,“并行計(jì)算”研究的四大分支,并行計(jì)算機(jī),體系結(jié)構(gòu),并行,算法,并行,程序設(shè)計(jì),并行計(jì)算的,性能評測,而介于并行計(jì)算機(jī),體系結(jié)構(gòu),與并行,算法,之間的是并行,計(jì)算模型,。,“并行計(jì)算”研究的四大分支并行計(jì)算機(jī)體系結(jié)構(gòu),Performance Evaluation,并行計(jì)算效能評價(jià),Performance Evaluation并行計(jì)算效能評價(jià),程序性能評價(jià)與優(yōu)化,給定并行算

3、法,采用并行程序設(shè)計(jì)平臺,通過并行實(shí)現(xiàn)獲得實(shí)際可運(yùn)行的并行程序后,一個重要的工作就是,在并行機(jī)上運(yùn)行該程序,評價(jià)該程序的實(shí)際性能,,揭示性能瓶頸,指導(dǎo)程序的性能優(yōu)化,。,性能評價(jià)和優(yōu)化是設(shè)計(jì)高效率并行程序必不可少的重要工作。,程序性能評價(jià)與優(yōu)化給定并行算法,采用并行程序設(shè)計(jì)平臺,通過并,并行程序執(zhí)行時(shí)間,評價(jià)并行程序的性能之前,必須清楚并行程序的執(zhí)行時(shí)間是由哪些部分組成的。眾所周知,獨(dú)享處理器資源時(shí),串行程序的執(zhí)行時(shí)間近似等于程序指令執(zhí)行花費(fèi)的CPU 時(shí)間。但是,并行程序相對復(fù)雜,其,執(zhí)行時(shí)間(execution time)等于從并行程序開始執(zhí)行,到所有進(jìn)程執(zhí)行完畢,墻上時(shí)鐘走過的時(shí)間,,也稱

4、之為,墻上時(shí)間,(wall time)。,對各個進(jìn)程,墻上時(shí)間可進(jìn)一步分解為:,計(jì)算CPU 時(shí)間,通信CPU 時(shí)間,同步開銷時(shí)間,進(jìn)程空閑時(shí)間,(是由同步導(dǎo)致的),并行程序執(zhí)行時(shí)間評價(jià)并行程序的性能之前,必須清楚并行程序的執(zhí),并行程序執(zhí)行時(shí)間,計(jì)算CPU 時(shí)間,進(jìn)程指令執(zhí)行所花費(fèi)的CPU 時(shí)間,它可以分解為兩個部分,一個是程序本身指令執(zhí)行占用的CPU 時(shí)間,即通常所說的用戶時(shí)間(user time),主要包含指令在CPU 內(nèi)部的執(zhí)行時(shí)間和內(nèi)存訪問時(shí)間,另一個是為了維護(hù)程序的執(zhí)行,操作系統(tǒng)花費(fèi)的CPU 時(shí)間,即通常所說的系統(tǒng)時(shí)間(system time),主要包含內(nèi)存調(diào)度和管理開銷、I/O 時(shí)間

5、、以及維護(hù)程序執(zhí)行所必需要的操作系統(tǒng)開銷等。通常地,系統(tǒng)時(shí)間可以忽略。,并行程序執(zhí)行時(shí)間計(jì)算CPU 時(shí)間,并行程序執(zhí)行時(shí)間,通信CPU 時(shí)間,包含進(jìn)程通信花費(fèi)的CPU 時(shí)間。,同步開銷時(shí)間,包含進(jìn)程同步花費(fèi)的時(shí)間,進(jìn)程空閑時(shí)間,當(dāng)一個進(jìn)程阻塞式等待其他進(jìn)程的消息時(shí),CPU 通常是空閑的,或者處于等待狀態(tài)。進(jìn)程空閑時(shí)間是指并行程序執(zhí)行過程中,進(jìn)程所有這些空閑時(shí)間的總和。,顯然,進(jìn)程的計(jì)算CPU 時(shí)間小于并行程序的墻上時(shí)間,而并行程序的,墻上時(shí)間,才是用戶真正關(guān)心的時(shí)間,是評價(jià)一個并行程序執(zhí)行速度的時(shí)間。,并行程序執(zhí)行時(shí)間通信CPU 時(shí)間,11/15/2024,9,/59,并行算法設(shè)計(jì)及效能分析,

6、并行算法效能分析,并行加速比,并行效率,可擴(kuò)展性,(簡單表述),處理機(jī)數(shù),p,增加時(shí),并行效率,E,p,不顯著下降。,8/8/20239/59并行算法設(shè)計(jì)及效能分析并行算法效能分,效能分析分析說明,需要說明的是,,T,1 指處理器個數(shù)為1 時(shí),并行程序的執(zhí)行時(shí)間。通常情形下,,T,1 大于,TS,,因?yàn)椴⑿谐绦蛲胍恍┤哂嗟目刂坪凸芾黹_銷。,加速比和效率是衡量一個并行程序性能的最基本的評價(jià)方法。顯然,執(zhí)行最慢的進(jìn)程將決定并行程序的性能。,在以上加速比和效率的定義中,有一個基本的假設(shè),要求并行機(jī)的各個處理器是同構(gòu)(homogeneous)的,即并行機(jī)各個處理器的結(jié)構(gòu)完全一致(包含CPU 類型

7、、內(nèi)存大小與性能、cache 特征等等),或者說,串行程序在各個處理器執(zhí)行的墻上時(shí)間相等。,效能分析分析說明需要說明的是,T1 指處理器個數(shù)為1 時(shí),并,效能分析分析說明,如果并行機(jī)的各個處理器功能不一致,稱之為異構(gòu)并行機(jī)。對此,以上加速比和效率的定義不是很合適。其中,兩個突出的問題就是,串行程序的執(zhí)行時(shí)間是選擇最快的處理器運(yùn)行,還是選擇最慢的處理器運(yùn)行?在效率定義中,處理器個數(shù)選擇為,P,是否合適?一個比較好的方法就是,將所有處理器以最快的處理器為基準(zhǔn),進(jìn)行歸一化處理。,效能分析分析說明如果并行機(jī)的各個處理器功能不一致,稱之為異構(gòu),并行程序性能評價(jià)方法,以上介紹的加速比和效率,只能反映并行程

8、序的整體執(zhí)行性能,但是,無法反映并行程序的性能瓶頸。性能評價(jià)的主要目的在于,揭示并行程序的性能瓶頸,指導(dǎo)并行程序的性能優(yōu)化。因此,有必要進(jìn)一步分解加速比和效率,提出更細(xì)致的性能評價(jià)方法。,并行程序性能評價(jià)方法以上介紹的加速比和效率,只能反映并行程序,并行計(jì)算性能評測,3.1 并行機(jī)的一些基本性能指標(biāo),3.2 加速比性能定律,3.2.1 Amdahl定律,3.2.2 Gustafson定律,3.2.3 Sun和Ni定律,3.3 可擴(kuò)放性評測標(biāo)準(zhǔn),3.3.1 并行計(jì)算的可擴(kuò)放性,3.3.2 等效率度量標(biāo)準(zhǔn),3.3.3 等速度度量標(biāo)準(zhǔn),3.3.4 平均延遲度量標(biāo)準(zhǔn),3.4 基準(zhǔn)測試程序,并行計(jì)算性能

9、評測3.1 并行機(jī)的一些基本性能指標(biāo),并行計(jì)算的性能評測,機(jī)器級,的性能評測,CPU和存儲器的某些基本性能指標(biāo),并行通信開銷,機(jī)器的成本、價(jià)格、和性能/價(jià)格比等,算法級,的性能評測,加速比,效率,可擴(kuò)展性,程序級,的性能評測,基本測試程序,數(shù)學(xué)庫測試,并行測試程序等,并行計(jì)算的性能評測機(jī)器級的性能評測,并行機(jī)基本性能參數(shù)一覽表,名稱,符號,含義,單位,機(jī)器規(guī)模,n,處理器的數(shù)目,無量綱,時(shí)鐘速率,f,時(shí)鐘周期長度的倒數(shù),MHz,工作負(fù)載,W,計(jì)算操作的數(shù)目,Mflops,順序執(zhí)行時(shí)間,T,1,程序在單處理機(jī)上的運(yùn)行時(shí)間,s,并行執(zhí)行時(shí)間,T,n,程序在并行機(jī)上的運(yùn)行時(shí)間,s,速度,R,n,=W

10、/T,n,每秒百萬次浮點(diǎn)運(yùn)算,Mflops,加速,S,n,=T1/T,n,衡量并行機(jī)有多快,無量綱,效率,E,n,=S,n,/n,衡量處理器的利用率,無量綱,峰值速度,R,peak,=nR,peak,所有處理器峰值(R,peak,)速度之積,Mflops,利用率,U=R,n,/R,peak,可達(dá)速度與峰值速度之比,無量綱,通信延遲,t,0,傳送0個字節(jié)或單字的時(shí)間,us,漸近帶寬,r,傳送長消息通信速率,MB/,s,并行機(jī)基本性能參數(shù)一覽表名稱符號含義單位機(jī)器規(guī)模n處理器的數(shù),工作負(fù)載,工作負(fù)載(荷):計(jì)算操作數(shù)目,執(zhí)行時(shí)間掠過時(shí)間:墻上時(shí)間,所執(zhí)行的指令數(shù)目,所完成的浮點(diǎn)運(yùn)算數(shù),工作負(fù)載工作

11、負(fù)載(荷):計(jì)算操作數(shù)目,CPU的某些基本性能指標(biāo),工作負(fù)載,執(zhí)行時(shí)間:程序從開始到結(jié)束的時(shí)間。,浮點(diǎn)運(yùn)算數(shù),指令數(shù)目:通常用百萬條指令,并行執(zhí)行時(shí)間,T,n,:T,comput,為計(jì)算時(shí)間,T,paro,為并行開銷時(shí)間,T,comm,為相互通信時(shí)間,T,n,=T,comput,+T,paro,+T,comm,例:估計(jì)APRAM模型下執(zhí)行時(shí)間,其中T,1,為串行時(shí)間,n為處理器數(shù),T,為使用無限多處理器且不考慮T,paro,與T,comm,的并行執(zhí)行時(shí)間,CPU的某些基本性能指標(biāo)工作負(fù)載,存儲器性能,存儲器的層次結(jié)構(gòu)(C,L,B),-容量C,延遲L,帶寬B,估計(jì)存儲器的帶寬,RISC指令 ad

12、d r1,r2,r3,寄存器 8bytes,主頻 100MHz,B=3*8*100*10,6,B/s=2.4GB/s,存儲器性能存儲器的層次結(jié)構(gòu)(C,L,B),并行與通信開銷,并行和通信開銷:相對于計(jì)算很大。,PowerPC (每個周期 15ns 執(zhí)行4flops;創(chuàng)建一個進(jìn)程1.4ms 可執(zhí)行372000flops),開銷的測量:乒-乓方法(Ping-Pong Scheme)節(jié)點(diǎn)0發(fā)送m個字節(jié)給節(jié)點(diǎn)1;節(jié)點(diǎn)1從節(jié)點(diǎn)0接收m個字節(jié)后,立即將消息發(fā)回節(jié)點(diǎn)0??偟臅r(shí)間除以2,即可得到點(diǎn)到點(diǎn)通信時(shí)間,也就是執(zhí)行單一發(fā)送或接收操作的時(shí)間。,可一般化為熱土豆法(Hot-Potato),也稱為救火隊(duì)法(F

13、ire-Brigade)01 2 n-1 0 即從節(jié)點(diǎn)0發(fā)送m字節(jié)給1,節(jié)點(diǎn)1給節(jié)點(diǎn)2,依次類推,最后節(jié)點(diǎn)n-1再將其返回給0,最后時(shí)間再除以n即可。,并行與通信開銷并行和通信開銷:相對于計(jì)算很大。,Ping-Pong Scheme,if(my _node _id=0)then/*發(fā)送者*/,start _time=second(),send an m-byte message to node 1 /發(fā)送,receive an m-byte message from node 1 /接收,end_time=second(),total_time=end_time start_time,comm

14、unication_timei=total_time/2,else if(my_node_id=1)then /*接收者*/,receive an m-byte message from node 0,send an m-byte message to node 0,endif,Ping-Pong Schemeif(my _node _,并行開銷的表達(dá)式:點(diǎn)到點(diǎn)通信,通信開銷,t,(,m,)=,t,0,+,m,/,r,通信啟動時(shí)間,t,0,漸近帶寬r,:傳送無限長的消息時(shí)的通信速率,m為傳輸?shù)淖止?jié)數(shù),半峰值長度m,1/2,:達(dá)到一半漸近帶寬所要的消息長度,特定性能,0,:表示短消息帶寬,t,0

15、,=m,1/2,/,r,=1/,0,并行開銷的表達(dá)式:點(diǎn)到點(diǎn)通信 通信開銷 t(m)=t0,并行開銷的表達(dá)式:組通信,典型的組通信有:,播送,(Broadcasting):處理器0發(fā)送m個字節(jié)給所有的n個處理器-,廣播,收集,(Gather):處理0接收所有n個處理器發(fā)來在消息,所以處理器0最終接收了,m,x,n,個字節(jié);,散射,(Scatter):處理器0發(fā)送了m個字節(jié)的不同消息給所有n個處理器,因此處理器0最終發(fā)送了,m,x,n,個字節(jié);,全交換,(Total Exchange):每個處理器均彼此相互發(fā)送m個字節(jié)的不同消息給對方,所以總通信量為,m,x,n,2,個字節(jié);,循環(huán)移位,(Cir

16、cular-shift):處理器i發(fā)送m個字節(jié)給處理器i+1,處理器n-1發(fā)送m個字節(jié)給處理器0,所以通信量為,m,x,n,個字節(jié)。,并行開銷的表達(dá)式:組通信典型的組通信有:,機(jī)器的成本、價(jià)格與性/價(jià)比,機(jī)器的成本與價(jià)格,機(jī)器的性能/價(jià)格比 Performance/Cost Ratio:系指用單位代價(jià)(通常以百萬美元表示)所獲取的性能(通常以MIPS或MFLOPS表示),利用率(Utilization):可達(dá)到的速度與峰值速度之比,機(jī)器的成本、價(jià)格與性/價(jià)比機(jī)器的成本與價(jià)格,并行計(jì)算性能評測,3.1 并行機(jī)的一些基本性能指標(biāo),3.2 加速比性能定律,3.2.1 Amdahl定律,3.2.2 Gustafson定律,3.2.3 Sun和Ni定律,3.3 可擴(kuò)放性評測標(biāo)準(zhǔn),3.3.1 并行計(jì)算的可擴(kuò)放性,3.3.2 等效率度量標(biāo)準(zhǔn),3.3.3 等速度度量標(biāo)準(zhǔn),3.3.4 平均延遲度量標(biāo)準(zhǔn),3.4 基準(zhǔn)測試程序,并行計(jì)算性能評測3.1 并行機(jī)的一些基本性能指標(biāo),算法級性能評測,加速比性能定律,并行系統(tǒng)的加速比是指對于一個給定的應(yīng)用,并行算法(或并行程序)的執(zhí)行速度相對于串行算法(或串行程序)

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